外卖超时扣款是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合同角度：
- 在外卖服务中，用户与外卖平台或商家之间形成了一种服务合同关系。合同中通常会明确服务的内容、标准、时间以及违约责任等条款。
- 如果合同中明确规定了外卖送达的时间限制，并且约定了超时送达的违约责任（如扣款），那么在商家或平台超时送达的情况下，按照合同约定进行扣款是合法的。
- 但需要注意的是，合同条款必须合法、合理，不能违反法律法规的强制性规定，也不能显失公平。如果合同中的扣款条款过于苛刻或不合理，可能被视为无效条款。
消费者权益保护角度：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品或接受服务时享有公平交易的权利。
- 如果外卖平台或商家在未经消费者同意的情况下，单方面扣款或设置不合理的扣款条款，可能侵犯了消费者的公平交易权。
- 在此情况下，消费者有权要求平台或商家退还扣款，并可以依法向相关部门投诉或寻求法律救济。
实际操作角度：
- 在实际操作中，外卖平台或商家通常会设置一定的超时送达扣款机制，以激励配送员提高配送效率。
- 然而，这种扣款机制应当合理、透明，并且应当事先告知消费者。如果消费者在不知情的情况下被扣款，或者扣款金额过高、不合理，那么这种扣款行为可能是不合法的。
建议：
- 对于消费者而言，在下单前应仔细阅读外卖平台或商家的服务条款和扣款规定，了解自己的权益和义务。
- 如果遇到超时送达扣款的情况，可以先与平台或商家沟通协商，要求退还扣款或解释扣款原因。
- 如果沟通无果或认为扣款行为不合法，可以向相关部门投诉或寻求法律救济。
总结：外卖超时扣款是否合法取决于合同条款的约定、消费者权益的保护以及实际操作中的合理性。如果您对外卖超时扣款有疑问或认为自己的权益受到侵害，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。