关于农村房子过不了户时所写协议是否有效的问题，这确实是一个涉及多方面法律因素的复杂情况。以下是我为您提供的详细分析：
一、协议有效的情形
同一集体经济组织成员间的交易：
- 如果买卖双方都是同一村集体经济组织的成员，且协议是基于双方真实、自愿的意思表示，同时协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这样的房屋买卖或赠与协议通常是有效的。例如，同村村民之间的房屋买卖，只要内容合法、双方自愿，即使暂时无法过户，协议也具有法律效力。
附条件的有效协议：
- 协议中可以约定生效条件，如待产权登记政策调整后生效。只要该条件不违反法律规定，且在条件成就时，协议即产生法律效力。
双方自愿且内容合法的协议：
- 无论是否存在过户障碍，只要协议是双方自愿、平等、真实的意思表示，且内容不违反国家法律法规的强制性规定，协议在形式上就是有效的。但需注意，协议有效并不等同于物权变动，过户登记仍是房屋所有权转移的必要条件。
二、协议无效的情形
向本集体经济组织以外的人转让房屋：
- 农村宅基地具有福利性质，与特定身份关系相联系。若买方非本集体经济组织成员（尤其是城镇居民），则房屋买卖协议通常无效，因为这违反了农村宅基地管理的相关规定。
违反法律、行政法规或违背公序良俗：
- 如协议内容违法（如涉及非法建造的房屋），或违背社会公德和善良风俗，则协议无效。
主体不适格或意思表示不真实：
- 如果签订协议的一方是无民事行为能力人，或者签订过程中存在欺诈、胁迫等情形，那么协议可能被认定无效或可撤销。
三、特别注意事项
不能替代过户手续：
- 即使协议有效，也不能代替正式的过户登记。过户登记是不动产物权变动的法定要件，没有过户登记，房屋所有权就不会发生转移。
咨询专业人士：
- 在签订协议前，建议咨询专业律师或相关机构，了解具体法律规定和政策要求，确保协议的合法性和有效性。
明确权利义务：
- 在协议中明确双方的权利和义务、违约责任等条款，以减少未来纠纷和风险。例如，可以约定卖方在过户条件成就时协助买方办理过户手续，以及违约时需承担的赔偿责任等。
四、风险与防范措施
- 风险：由于房子无法过户，买方可能面临卖方反悔或再次出售的风险，导致无法取得房子的所有权。
- 防范措施：
- 在签订协议前，双方应充分了解房子的产权情况，确保交易的合法性。
- 可以考虑采取一些措施来降低风险，如要求卖方提供担保或设定违约金等条款。
- 最好通过正规的房屋交易程序来完成房屋的买卖和过户，以确保双方的权益得到更好的保障。
综上所述，农村房子过不了户时签订的协议在满足一定条件下是具有法律效力的。但为了确保自身权益得到充分保障，建议您在签订协议前咨询专业律师，并采取必要的防范措施以降低风险。