合同逾期后，陆续还款时逾期金额的认定是一个涉及合同条款、逾期时间、还款情况等多方面的复杂问题。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
一、查阅合同条款
首先，应仔细查阅合同或借款协议中的相关条款，特别是关于借款总额、已还款金额、逾期利率、逾期违约金计算标准等关键信息。这些条款是计算逾期金额的基础，也是后续处理逾期问题的法律依据。
二、计算逾期金额
根据合同中的约定，逾期金额的计算通常包括以下几个部分：
应还而未还的本金：即合同约定的到期应还本金中尚未偿还的部分。
逾期利息：根据合同约定的逾期利率和逾期时间计算出的利息。如果合同中有明确的逾期利率，则按该利率计算；如果合同中没有明确约定，则可能按照相关法律法规或行业惯例确定。
逾期违约金：如果合同中规定了逾期违约金的计算标准，如按照逾期天数乘以某一固定比例或约定的固定金额，则按照这些标准计算违约金并纳入逾期金额中。
其他损失赔偿：如果因逾期而导致了实际的经济损失，并且合同中有相应的规定，那么这部分损失也应计入逾期金额中。但需要注意的是，损失赔偿额应相当于因违约行为所带来的全部损失，包括合同完全履行后可能获得的利益，但总计不能超过违约方在签订合同时所能预见的或理应预见到的因违反合同可能会带来的损失。
三、陆续还款的处理
在陆续还款的过程中，每次还款都应按照合同约定的还款顺序进行抵扣。通常，还款会先抵扣逾期利息和违约金，然后再抵扣应还本金。因此，在每次还款后，都需要重新计算剩余逾期金额，以便准确了解还款进度和剩余债务情况。
四、与贷款机构沟通
在还款过程中，建议积极与贷款机构沟通，说明逾期原因及还款计划。部分贷款机构可能会提供延期还款、分期还款等灵活方案，以减轻还款压力。同时，通过与贷款机构的沟通，也可以及时了解还款进度和剩余债务情况，避免产生不必要的误解和纠纷。
五、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。因此，在合同逾期后，借款人需要按照合同约定或相关法律法规的规定支付逾期利息和其他相关费用。
综上所述，合同逾期后陆续还款时逾期金额的认定是一个综合考虑合同条款、逾期时间、还款情况等多方面的复杂问题。借款人应仔细查阅合同条款、准确计算逾期金额、制定切实可行的还款计划并积极与贷款机构沟通，以确保顺利解决逾期问题并避免产生不必要的法律纠纷。