还款计划协议中逾期金额的计算，需根据协议具体条款及法律规定综合判定，核心计算逻辑为：逾期金额=到期未还本金+逾期利息+违约金（如有约定）-已偿还部分。具体分情况说明如下：

1. 基础计算：到期未还本金+逾期利息

• 到期未还本金：指协议约定的还款期限届满后，借款人未偿还的借款本金部分。例如，协议约定每月5日还款1万元，若借款人仅偿还5000元，则到期未还本金为5000元。
• 逾期利息：若协议约定了逾期利率（通常高于正常利率），则逾期利息=到期未还本金×逾期利率×逾期天数。例如，逾期利率为日万分之五，逾期10天，则逾期利息=5000元×0.05%×10=25元。
• 法律依据：根据《民法典》第六百七十六条，借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。

2. 违约金条款的适用

• 若协议中明确约定了逾期违约金（如按未还金额的百分比计算），则违约金需叠加至逾期金额中。例如，协议约定逾期违约金为未还金额的5%，则违约金=5000元×5%=250元。
• 注意：违约金与逾期利息可能并存，但需符合《民法典》第五百八十五条关于违约金过高的调整规则（即违约金超过实际损失30%的，法院可能予以调减）。

3. 已偿还部分的抵扣

• 若借款人在逾期后部分还款，需优先抵扣逾期利息、违约金，再抵扣本金。例如，借款人逾期后偿还3000元，其中25元为逾期利息，250元为违约金，剩余2725元抵扣本金，则剩余未还本金=5000元-2725元=2275元。

4. 特殊情形：复利计算

• 若协议约定逾期利息按复利计算（即“利滚利”），则逾期金额=到期未还本金×（1+逾期利率）^逾期天数-已偿还部分。但需注意，复利约定需明确写入协议，且利率不得超过法律保护的上限（如LPR的四倍）。

实务建议

1. 核查协议条款：优先以协议约定的计算方式为准，若条款模糊，可主张按法定标准计算。
2. 保留还款证据：借款人应留存还款凭证，避免出借人主张全额逾期。
3. 协商调整：若因客观原因逾期，可与出借人协商延期或减免违约金，降低损失。

如有具体协议条款或计算争议，可直接提供协议内容，我将进一步分析计算逻辑及合法性。