执业药师注册在药店辞职后，需及时办理变更注册或注销注册手续，并妥善处理与原药店的劳动关系及可能涉及的竞业限制等问题。具体分析如下：

1. 变更注册或注销注册
   根据《执业药师注册管理办法》相关规定，执业药师变更执业单位、执业范围等应当及时办理变更注册手续。若辞职后不再从事执业药师相关工作，则需办理注销注册。

   • 变更注册流程：需向原注册机构提交变更注册申请表、新执业单位合法开业证明、原注册证等材料，经审核通过后领取新注册证。
     
   • 注销注册情形：包括死亡或被宣告失踪、受刑事处罚、被吊销执业药师资格证、健康原因不适宜执业等。若主动辞职且无上述情形，可自愿申请注销。
     
   • 法律后果：未及时办理变更或注销注册而继续执业的，可能面临警告、罚款等行政处罚（《执业药师注册管理办法》第三十四条）。

2. 劳动关系处理

   • 解除劳动合同：需与原药店协商解除劳动合同，或依据《劳动合同法》第三十七条提前30日书面通知解除。若药店存在未足额支付工资、未缴纳社保等违法行为，可主张被迫解除并要求经济补偿。
     
   • 工作交接：应按药店要求完成药品库存盘点、处方档案移交等手续，避免因交接不清引发纠纷。
     
   • 竞业限制义务：若与药店签订竞业限制协议，辞职后需遵守协议约定，否则可能需支付违约金（《劳动合同法》第二十三条）。

3. 其他注意事项

   • 社保转移：及时办理养老保险、医疗保险等社保关系转移手续，确保权益连续。
     
   • 执业责任：辞职后仍需对在职期间签署的处方、药品质量等问题承担相应法律责任，建议保留相关记录备查。
     
   • 再就业准备：若计划入职新药店，需确认新单位具备合法执业资质，并重新办理注册手续。

建议行动步骤：

1. 立即向原注册机构提交变更或注销注册申请；
   
2. 与药店协商解除劳动合同并完成工作交接；
   
3. 检查竞业限制协议条款，评估再就业限制；
   
4. 办理社保转移及档案存放手续。
   

如有具体纠纷（如药店拒不办理注销、克扣工资等），可进一步提供细节，我将结合《劳动合同法》《执业药师注册管理办法》等法规为您分析解决方案。