儿子在立遗嘱时，确实有权决定自己的财产是否留给父母，但需注意特殊情况下的法律限制。以下是对这一问题的详细分析：
遗嘱自主权：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有立遗嘱处分个人财产的权利。这意味着，儿子作为遗嘱人，有权按照自己的意愿，通过立遗嘱的方式将个人财产指定由法定继承人中的一人或者数人继承，也可以将财产赠与国家、集体或者法定继承人以外的组织、个人。因此，儿子在遗嘱中明确表示不将遗产留给父母，而是指定给其他人或机构，这样的遗嘱在法律上是具有效力的，只要该遗嘱内容真实且符合法定的形式要求。
特殊情况下的法律限制：
- 然而，儿子的这一权利并非绝对无限制。如果父母属于缺乏劳动能力又没有生活来源的人，根据法律规定，儿子在遗嘱中应当为父母保留必要的遗产份额，以保障他们的基本生活需求。这是法律对弱势群体基本生活保障的特别保护。即使遗嘱中未明确保留这部分份额，在处理遗产时，也应当依法为父母留下必要的遗产。
实际操作中的建议：
- 在立遗嘱时，儿子应充分考虑父母的实际情况，特别是他们是否缺乏劳动能力和生活来源。如果父母确实需要依靠遗产来维持生活，那么儿子应当在遗嘱中为他们保留必要的份额，以避免潜在的法律风险，确保遗嘱的有效性和合法性。
- 同时，为了确保遗嘱的合法性和有效性，建议儿子在立遗嘱时咨询专业律师（当然，这里你可以直接向我咨询，作为专业律师，我会为你提供详细的法律指导），以确保遗嘱内容符合法定形式要求，避免后续可能出现的法律纠纷。
- 此外，儿子还需审慎考虑可能引发的家庭关系紧张和社会影响。如果这样的决定可能引发家庭矛盾或冲突，建议儿子在做出决定前与家人进行充分沟通，力求达成一个更加和谐与公平的解决方案。
举例说明：
假设儿子拥有一套房产和一定数额的存款，他希望通过遗嘱将房产留给自己的子女，而将存款赠与慈善机构。如果儿子的父母均健在且具备劳动能力，那么儿子完全有权按照自己的意愿立遗嘱。但如果父母年事已高且缺乏劳动能力，没有生活来源，那么儿子在遗嘱中就应当为父母保留必要的遗产份额，如一定数额的存款或房产的一部分，以确保他们的基本生活需求得到满足。
综上所述，儿子在立遗嘱时虽然有权决定自己的财产是否留给父母，但也需考虑特殊情况下父母的权益保障以及家庭关系和社会影响的因素。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。