当按摩店技师在店内被客人打了，这是一个非常严重且需要妥善处理的问题。以下是一些建议的处理步骤，希望能帮助您维护自己的合法权益：

一、确保自身安全

首先，要确保自己的生命安全不受进一步威胁。如果客人仍在现场且情绪激动，应尽量避免与其发生直接冲突，可以迅速离开现场或寻找安全的地方躲避，并及时通知店内其他工作人员或保安前来协助。

二、及时报警

在确保自身安全后，应立即拨打110报警电话或前往辖区派出所报案。详细陈述被打的时间、地点、经过以及施暴者的特征等信息，要求警方出具报警回执。警方会迅速出警制止暴力行为，调查案件情况，并对现场进行调查取证，如制作询问笔录、收集现场证人证言、调取监控录像等。

三、就医检查并保留证据

尽快前往正规医院进行全面检查和治疗，告知医生受伤原因。同时，要妥善保存好病历、诊断证明、检查报告、医疗费用票据等所有与受伤相关的材料。这些材料是证明受伤情况及治疗花费的重要依据，对于后续的索赔至关重要。

四、进行伤情鉴定

配合警方安排去指定机构做伤情鉴定。伤情鉴定结果是判断打人者责任的重要依据。如果鉴定为轻微伤，打人者可能面临治安拘留和罚款等处罚；如果鉴定为轻伤及以上，打人者则涉嫌故意伤害罪，需要承担刑事责任。

五、协商赔偿

在伤情鉴定结果出来后，可以与打人者及其家属就赔偿问题进行协商。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，可以要求赔偿因被打造成的经济损失，包括医疗费、误工费、护理费、交通费、营养费等。如果协商达成一致，应签订书面赔偿协议，以确保双方权益得到保障。

六、提起诉讼

如果协商不成，或者打人者拒绝承担赔偿责任，可以向法院提起民事诉讼，要求打人者承担民事赔偿责任。如果构成刑事犯罪，还可以在刑事诉讼中附带民事诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

七、了解相关法律法规

在处理此类事件时，了解相关的法律法规是非常重要的。例如，《中华人民共和国民法典》规定了侵害他人造成人身损害的赔偿责任；《中华人民共和国治安管理处罚法》规定了殴打他人的治安处罚；《中华人民共和国刑法》则规定了故意伤害他人身体的刑事责任。这些法律法规将为您提供有力的法律支持。

总之，当按摩店技师在店内被客人打了时，应保持冷静、及时报警、就医检查并保留证据、进行伤情鉴定、协商赔偿或提起诉讼，并了解相关法律法规以维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。