员工阻碍公司经营是否违法，需根据具体行为性质、情节及后果综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
1. 若员工行为构成违法或犯罪
- 违法行为：若员工通过暴力、威胁、非法拘禁等手段阻碍公司经营，可能违反《治安管理处罚法》，面临行政处罚（如拘留、罚款）。例如，员工因不满公司决策，聚众堵门、破坏设备，干扰正常办公秩序，公安机关可依法处罚。
- 犯罪行为：若行为情节严重，可能构成犯罪。如：
- 破坏生产经营罪（《刑法》第二百七十六条）：员工因泄愤报复，毁坏机器设备、残害耕畜或以其他方法破坏生产经营，造成严重损失的，可处三年以下有期徒刑、拘役或管制。
- 聚众扰乱社会秩序罪（《刑法》第二百九十条）：员工纠集多人扰乱公司秩序，致使工作、生产无法进行，造成严重损失的，对首要分子可处三年以上七年以下有期徒刑。
2. 若员工行为属于劳动争议范畴
- 合法维权与违法行为的界限：员工若因劳动权益争议（如欠薪、未缴社保）采取过激行为（如停工、静坐），需区分合法维权与违法阻碍经营：
- 合法维权：员工可通过协商、投诉、申请劳动仲裁等合法途径解决争议。例如，员工因公司拖欠工资，集体向劳动监察部门投诉，属于合法行为。
- 违法行为：若员工以“维权”为名，采取暴力、威胁、堵塞通道等手段干扰公司正常经营，可能构成违法。例如，员工为迫使公司妥协，占据办公室、阻止客户进入，导致公司无法运营，可能面临行政处罚或民事赔偿。
3. 若员工行为违反公司规章制度
- 公司内部处理：若员工行为未达到违法或犯罪程度，但违反公司规章制度（如《员工手册》中禁止“扰乱工作秩序”的条款），公司可依据内部规定处理，包括警告、扣薪、解除劳动合同等。但需注意：
- 规章制度合法性：公司规章制度需经民主程序制定并公示，否则可能被认定为无效。
- 处理程序合规性：公司解除劳动合同需符合《劳动合同法》规定（如提前通知、支付经济补偿等），否则可能构成违法解除。
4. 民事赔偿责任
- 损害赔偿：若员工行为导致公司财产损失（如设备损坏、客户流失），公司可要求员工承担民事赔偿责任。例如，员工因个人情绪砸毁公司电脑，需赔偿维修或更换费用。
法律建议
- 对员工：若与公司存在争议，应通过合法途径维权，避免采取过激行为导致法律风险。
- 对公司：若员工行为违法或犯罪，应及时报警；若属劳动争议，可通过协商、仲裁或诉讼解决；同时完善规章制度，明确行为规范及处理流程。
如有具体行为情节或争议，可直接向我咨询，我将结合事实与法律提供详细分析。