劳动合同丢失并不影响劳动者申请劳动仲裁的权利。只要劳动者能够提供其他有效证据证明与用人单位之间存在劳动关系，即可依法向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。以下是对这一问题的详细分析：

一、劳动仲裁的受理条件与劳动合同的关系

根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动仲裁的申请并不以持有劳动合同为前提条件。只要满足以下条件，劳动争议仲裁委员会就应当受理仲裁申请：

1. 申请人与本案有直接利害关系；
2. 有明确的被申请人；
3. 有具体的仲裁请求和事实、理由；
4. 属于劳动争议仲裁委员会的受理范围和管辖范围。

因此，即使劳动合同丢失，只要劳动者符合上述条件，仍有权申请劳动仲裁。

二、证明劳动关系的替代证据

在劳动合同丢失的情况下，劳动者可以通过提供其他相关材料来证明与用人单位存在劳动关系。这些替代证据包括但不限于：

1. 工资支付凭证或记录：如银行转账记录、工资条等，这些记录能直接显示用人单位向劳动者支付劳动报酬的事实，是认定劳动关系的重要证据。
2. 社保缴费记录：社保缴费记录也是证明劳动关系的有力证据，它显示了用人单位为劳动者缴纳社保的情况。
3. 工作证、服务证等证件：这些证件上通常会印有劳动者的姓名、照片、工作部门、职位等信息，并且加盖用人单位的公章，是劳动者在用人单位工作的直接证明。
4. 考勤记录：包括纸质考勤表、电子考勤记录等，能够反映劳动者的出勤情况，证明劳动者按照用人单位的要求提供劳动。如果劳动者无法直接获取考勤记录，可以在仲裁时申请仲裁委要求用人单位提供，因为用人单位对考勤记录等证据负有保管责任。
5. 其他劳动者的证言：其他在职或离职员工的证人证言也可以作为证明劳动关系的辅助证据。证人需要能够清晰地描述劳动者在用人单位的工作情况。
6. 工作过程中的文件资料：如工作任务分配单、业务合同、项目报告等，这些材料如果包含劳动者的签字或能体现劳动者的工作内容，同样可以作为证明劳动关系的证据。

三、实际操作建议

1. 及时收集证据：在劳动合同丢失后，劳动者应尽快收集并整理上述替代证据，以确保在申请劳动仲裁时有足够的证据支持自己的主张。
2. 咨询专业意见：在申请劳动仲裁前，劳动者可以向我咨询具体的法律建议和帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
3. 遵循法律程序：在申请劳动仲裁时，劳动者应遵循相关法律法规的规定，按照法定程序进行申请和举证。

举例说明：假设劳动者小张因劳动合同丢失而担心无法申请劳动仲裁。他可以通过提供银行工资流水明细、社保缴费记录、工作证以及同事的证言等证据来证明与用人单位存在劳动关系。这些证据将构成一个完整的证据链，支持小张的仲裁请求。

综上所述，即使劳动合同丢失，劳动者仍然可以凭借其他相关证据来申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。在申请过程中，劳动者应注重证据的收集和整理，并遵循相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。