企业扣款员工工资超过员工当月工资的20%，并且扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准的，属于违法行为。以下从不同角度为你详细分析：
合法扣款的情形与限度
法定扣款：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
- 计算公式：合法扣款上限 = 员工当月工资 × 20%
- 举例：若员工当月工资为5000元，则企业最多可扣款1000元（5000元 × 20%）。
扣除后工资不得低于最低工资标准：
- 扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这是为了保障劳动者的基本生活需求。
- 举例：若当地月最低工资标准为2000元，员工当月工资为2500元，即使按照20%的比例扣款（即500元），扣除后的工资（2000元）也刚好等于最低工资标准，此时扣款是合法的；但如果员工当月工资为2200元，按照20%的比例扣款（即440元）后，剩余工资为1760元，低于最低工资标准，此时扣款就是违法的。
违法扣款的法律后果
- 行政责任：用人单位违法扣除劳动者工资的，由劳动行政部门责令限期支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
- 民事责任：劳动者有权要求用人单位支付被违法扣除的工资，并可能要求用人单位支付额外的经济补偿或赔偿金。
- 刑事责任：在极端情况下，如果用人单位的违法行为构成犯罪（如恶意拖欠工资等），相关责任人员可能面临刑事处罚。不过，这种情况相对较少见，且通常涉及更严重的违法行为。
应对建议
- 保留证据：如果员工认为企业扣款违法，应首先保留好相关证据，如工资条、扣款通知、劳动合同等。
- 协商解决：尝试与企业进行协商，说明扣款的违法性，并要求企业纠正。
- 投诉举报：如果协商无果，可以向当地劳动行政部门投诉举报，要求劳动行政部门介入调查并处理。
- 法律诉讼：在必要时，员工还可以向法院提起诉讼，要求企业支付被违法扣除的工资及相应的经济补偿或赔偿金。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。