公司做虚假员工工资将面临多方面的法律处罚，具体如下：
一、行政责任
税务部门处罚：
- 补缴税款及滞纳金：若公司通过虚假员工工资虚增成本、少申报纳税，税务机关将追缴其不缴或少缴的税款及滞纳金。滞纳金按每日万分之五计算，从税款滞纳之日起算。
- 罚款：税务机关可根据情节轻重对公司处以罚款，一般为不缴或少缴税款的百分之五十以上五倍以下。例如，若公司因虚假工资少缴企业所得税10万元，除补缴税款和滞纳金外，还可能面临5万元至50万元的罚款。
劳动行政部门处罚：
- 责令改正：若虚假申报涉及克扣、拖欠员工工资，劳动行政部门将责令公司限期改正，确保员工工资得到足额支付。
- 加付赔偿金：逾期不改的，公司将需按应付金额的百分之五十以上百分之一百以下向员工加付赔偿金。例如，若公司拖欠员工工资5万元，逾期未支付，则需额外支付2.5万元至5万元的赔偿金。
其他行政处罚：
- 根据《中华人民共和国公司法》，公司在财务会计报告上作虚假记载或隐瞒重要事实的，直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能面临三万元以上三十万元以下的罚款。
二、刑事责任
- 逃税罪：如果公司虚假申报员工工资的行为构成逃税罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大且占应纳税额百分之三十以上的，可能处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
- 职务侵占罪：若公司工作人员利用职务便利，将虚报的工资非法占为己有，且数额较大，将构成职务侵占罪，面临更严厉的刑事处罚，包括有期徒刑和罚金。
- 贪污罪：对于国有公司、企业或其他国有单位中从事公务的人员，以及这些单位委派到非国有单位从事公务的人员，若实施上述行为，将依照贪污罪的规定定罪处罚。
三、民事责任
- 公司做虚假员工工资可能侵害员工权益，员工有权通过劳动仲裁或民事诉讼要求公司补足工资差额、支付经济补偿等。如因虚假工资记录导致员工未及时足额获得工资，员工还有权要求公司支付相应的经济补偿。
四、其他法律后果
企业信誉受损：
- 虚假员工工资行为一旦被发现，企业的形象和声誉将受到严重损害，进而影响其市场交易、融资及整体经营发展。
员工解雇与法律责任：
- 若员工参与虚假工资行为且情节严重，公司有权解除劳动合同。同时，员工也可能因构成相关犯罪而依法被追究刑事责任。
建议与总结：
公司应严格遵守相关法律法规，建立健全的工资管理制度，确保工资申报的真实性和准确性。同时，员工在发现公司存在虚假申报工资的行为时，应积极采取措施维护自己的权益，包括收集证据、与公司沟通、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。