针对您已经离职但安全员证仍在公司的情况，以下是我为您提供的详细解答和建议：

首先，您需要明确的是，安全员证是您的个人职业资格证书，其所有权和使用权应归您个人所有。在您离职后，公司无权继续留存或使用您的证书。若公司不配合您进行证书的转注或注销，您可以采取以下措施：

一、与公司协商

1. 沟通协商：

   • 您可以首先尝试与公司进行友好沟通，明确表达您的诉求，即要求公司协助您办理证书的转注或注销手续。
   • 在沟通过程中，您可以提供离职证明、劳动合同终止证明等相关材料，以证明您与公司已无劳动关系。

2. 书面通知：

   • 如果口头沟通无果，您可以向公司发送书面通知，明确要求公司在一定期限内（如15个工作日）协助您办理证书的转注或注销手续。
   • 书面通知应保留好副本，以备后续可能的法律程序使用。

二、寻求劳动仲裁或司法程序

1. 劳动仲裁：

   • 如果公司拒绝配合您办理证书的转注或注销手续，您可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁。
   • 在申请劳动仲裁时，您需要提供相关证据材料，如离职证明、劳动合同、书面通知等，以证明公司存在违法行为。

2. 司法程序：

   • 如果劳动仲裁结果不满意或公司不履行仲裁裁决，您可以向法院提起诉讼。
   • 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据材料来支持您的诉求，并可能需要聘请律师来协助您处理法律事务。

三、到相关部门申请注销

1. 准备材料：

   • 在采取法律手段之前或同时，您可以准备相关材料到企业所在地市建设局窗口申请注销安全员证。
   • 所需材料可能包括离职证明、劳动合同终止证明、身份证复印件、证书原件等。

2. 申请注销：

   • 您可以向建设局窗口工作人员说明情况，并提交相关材料申请注销证书。
   • 工作人员会审核您的材料，并告知您注销流程和所需时间。

四、注意事项

1. 保留证据：

   • 在整个过程中，您需要保留好所有相关证据材料，如离职证明、劳动合同、书面通知、仲裁裁决书、法院判决书等。
   • 这些证据材料将有助于您在后续的法律程序中维护自己的权益。

2. 关注证书有效期：

   • 您需要关注安全员证的有效期，避免在证书过期后无法正常使用或注销。
   • 如果证书即将过期或已过期，您需要及时与相关部门联系并了解续期或注销流程。

3. 了解相关法律法规：

   • 在处理此类问题时，您需要了解相关的法律法规和政策规定，以便更好地维护自己的权益。
   • 您可以咨询当地劳动部门、建设局或法律专业人士来获取更详细的信息和建议。