侵占公司财产5000元，根据不同情况，处理方式有所不同，具体如下：

1. 民事层面：

   • 追偿与赔偿：公司有权要求侵占者返还被侵占的财产，即5000元。如果侵占行为给公司造成了其他损失，如因财产缺失导致的业务中断、额外成本支出等，公司还可以要求侵占者进行相应的赔偿。
   • 内部处理：公司可以根据内部的规章制度，对侵占者进行纪律处分，如警告、罚款、降职、解雇等。这些措施旨在维护公司的内部秩序和纪律，防止类似行为再次发生。

2. 刑事层面（若构成犯罪）：

   • 职务侵占罪：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如果侵占者是公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，可能构成职务侵占罪。不过，职务侵占罪的立案标准通常较高，一般要求侵占数额在6万元以上（具体标准可能因地区而异）。因此，5000元的侵占行为可能不构成职务侵占罪，但具体还需根据当地司法实践和具体案情来判断。
   • 其他罪名：如果侵占行为伴随有其他违法犯罪行为，如伪造公司文件、诈骗等，且这些行为单独或共同构成了犯罪，那么侵占者可能会因这些罪名而受到刑事处罚。

3. 行政层面：

   • 劳动监察介入：如果侵占行为涉及劳动争议或违反劳动法规，公司可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
   • 工商行政处罚：如果侵占行为涉及公司商业秘密、知识产权等，且违反了工商行政管理法规，公司还可以向工商行政管理部门投诉，请求其对侵占者进行行政处罚。

建议：

• 收集证据：公司应尽快收集与侵占行为相关的证据，如财务记录、监控录像、证人证言等，以便在后续处理中证明侵占行为的存在和侵占者的身份。
• 咨询专业意见：由于法律问题的复杂性和专业性，建议公司在处理此类事件时咨询专业律师的意见，以确保处理方式的合法性和有效性。
• 加强内部管理：公司应加强对内部财产的管理和监督，建立健全的内部控制制度，防止类似侵占行为再次发生。

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