针对您提出的“国企改制程序不合法怎么办”的问题，这是一个涉及国有企业改革和法律程序的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，国有企业改制是一个复杂而严谨的过程，它必须遵循国家相关的法律法规和政策要求，确保改制程序的合法性和合规性。如果发现国企改制程序存在不合法的情况，我们可以从以下几个方面来应对：
一、核实改制程序的合法性
- 审查改制方案：检查改制方案是否按照现代企业制度要求制定，是否明确了改制方式、产权结构设置、债权债务处理、公司治理安排等关键事项。
- 核查审批程序：确认改制是否经过了严格的审批程序，特别是对于中央企业集团层面改制为国有独资公司或股权多元化企业，是否获得了相应的批准。
- 检查资产评估和交易：查看是否按照有关规定履行了清产核资、财务审计、资产评估、进场交易等程序，确保资产评估的公正性和交易的透明性。
二、采取应对措施
- 内部纠正：如果发现改制程序存在不合法或不合规的情况，首先应在企业内部进行纠正，重新审视和调整改制方案，确保符合法律法规和政策要求。
- 向上级报告：对于无法内部解决的问题，应及时向上级主管部门或国有资产监督管理机构报告，寻求指导和支持。
- 法律途径：如果改制程序的不合法性已经造成了严重后果，如国有资产流失、职工权益受损等，可以通过法律途径来维护自身权益，包括提起行政诉讼或民事诉讼等。
三、预防未来风险
- 加强监管：国有企业应加强对改制过程的监管，确保每一步都符合法律法规和政策要求，防止类似问题的再次发生。
- 完善制度：建立健全的改制管理制度和流程，明确各环节的责任和义务，提高改制的透明度和公正性。
- 培训和教育：加强对企业管理人员和职工的培训和教育，提高他们的法律意识和合规意识，确保改制工作的顺利进行。
四、参考相关政策文件
在处理国企改制程序不合法的问题时，还可以参考相关的政策文件，如《国务院办公厅关于印发中央企业公司制改制工作实施方案的通知》和《关于规范国有企业改制工作的意见》等。这些文件对国有企业改制的全过程进行了规范，提出了明确的政策要求，可以为处理类似问题提供有力的政策支持。
总之，国企改制程序不合法是一个需要高度重视的问题。我们应该通过核实改制程序的合法性、采取应对措施、预防未来风险以及参考相关政策文件等方式来妥善处理这一问题，确保国有企业改制的顺利进行和国有资产的保值增值。