办了不动产证，农村自建房在一般情况下可视为合法，但并非绝对，还需满足其他条件。具体分析如下：
不动产证的法律意义
不动产证是房屋合法性的重要证明文件，它表明房屋已经通过了相关部门的审核，符合土地利用规划、建设规划等要求，并已经完成了登记手续。因此，拥有不动产证是农村自建房合法性的一个重要标志。
合法性的其他条件
尽管不动产证是房屋合法性的重要证明，但农村自建房的合法性还受到其他多种因素的影响，包括但不限于：
- 土地性质：房屋必须建在合法的宅基地上，且宅基地的使用必须符合相关法律法规的规定。如果房屋建在了非宅基地上，或者宅基地的使用存在违法情况，那么即使拥有不动产证，房屋也可能被认定为违法建筑。
- 建设规划：房屋的建设必须符合当地的城乡规划和建设要求。如果房屋的建设违反了规划要求，如超出了规定的建筑面积、高度等，那么即使拥有不动产证，也可能面临被拆除或整改的风险。
- 审批手续：在建设农村自建房时，必须按照相关规定办理审批手续。如果未经审批擅自建设，或者审批手续不齐全，那么即使后续补办了不动产证，房屋也可能被视为违法建筑。
特殊情况下的合法性
在某些特殊情况下，即使农村自建房没有不动产证，也可能被视为合法。例如，如果房屋是在历史遗留问题下建设的，且符合当地的相关政策规定，那么可能不需要补办不动产证也能被认定为合法建筑。但这种情况较为特殊，且需要具体政策支持。
建议：
- 在建设农村自建房时，务必确保土地性质合法、符合建设规划要求，并办理齐全的审批手续。
- 如果已经拥有了不动产证，但房屋仍存在违法情况（如超建、违建等），建议及时整改以符合法律法规要求。
- 如果对农村自建房的合法性有疑问或遇到相关法律问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供详细的法律解答和建议。