首先，拿了农村不动产证并不意味着房屋就一定是合法的。农村不动产证的颁发，是对房屋所有权和土地使用权的一种确认，但它并不直接决定房屋的合法性。房屋的合法性还需要考虑其他多个因素。
土地性质与用途：
- 农村宅基地是用于农民居住的，如果房屋建设在宅基地上，并且符合当地规划和建设要求，那么房屋通常是合法的。
- 但如果房屋建设在非宅基地上，如农用地、林地等，或者违反了当地的规划和建设要求，那么即使有了不动产证，房屋也可能是违法的。
建设手续：
- 房屋建设需要办理一系列的手续，包括申请、审批、规划、施工许可等。如果这些手续不齐全，或者存在违规操作，那么房屋也可能被视为违法建筑。
法律法规变化：
- 法律法规可能会随着时间的推移而发生变化。如果房屋在建设时符合当时的法律法规，但后续法律法规发生了变化，导致房屋不再符合新的要求，那么房屋的合法性也可能会受到影响。
因此，虽然农村不动产证是房屋所有权和土地使用权的重要证明，但并不能直接决定房屋的合法性。如果你对房屋的合法性有疑问，建议咨询当地的自然资源部门或相关部门，以获取最准确的信息和建议。同时，我也可以提供关于房产纠纷、遗产继承等方面的法律咨询，如果你有相关问题，可以直接向我提问。