针对您提出的“案件超期如何处理”的问题，这主要涉及到行政处罚案件的处理期限及其超期后的法律后果。以下是我为您提供的详细解答：

一、行政处罚案件的处理期限

根据《行政处罚法》及相关法规的规定，行政机关在发现公民、法人或其他组织有依法应当给予行政处罚的行为时，应当及时立案并展开调查。对于行政处罚案件的处理期限，一般规定为自立案之日起九十日内作出行政处罚决定，但法律、法规、规章另有规定的，从其规定。例如，《治安管理处罚法》就规定了公安机关办理治安案件的期限，自受理之日起不得超过三十日，案情重大、复杂的，经上一级公安机关批准，可以延长三十日。

二、案件超期的认定

在判断行政处罚案件是否超期时，需要计算自受理之日或者立案之日起至处罚决定作出之日止的实际处理期限，并扣除应当扣除的期限（如管辖权异议、专业检测、检验和鉴定、公告等）。如果实际处理期限超过了法定或规定的期限，即构成案件超期。

三、案件超期的法律后果

1. 程序轻微违法或一般违法：

   • 如果行政处罚轻微超期或一般超期，且稳定的社会秩序尚未形成，人民法院可能会判决确认行政处罚违法，但保留其效力。这是因为，虽然程序上存在瑕疵，但并未对相对人的权利产生实质性影响，且撤销行政处罚可能会破坏已初步形成的社会秩序。

2. 严重超期：

   • 如果行政处罚严重超期，且处罚时稳定的社会秩序已经形成，那么该行政处罚不再属于程序轻微违法或者一般违法情形。在这种情况下，人民法院宜判决撤销行政处罚决定。这是因为，严重超期的行政处罚不仅违反了法定程序，而且可能对相对人的权利产生了实质性影响，撤销行政处罚是维护法治秩序和相对人合法权益的必要措施。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果行政处罚虽然存在严重超期，但撤销会给国家利益、社会公共利益造成重大损害的，那么人民法院不得判决撤销行政处罚。这是为了平衡法的安定性价值和行政法治的价值，避免因撤销行政处罚而引发更大的社会问题。

四、其他注意事项

• 综合判断因素：在判断行政处罚案件是否超期及其法律后果时，除了考虑处理期限的长短外，还需要结合违法行为的性质、情节、社会危害程度，超过处理期限的原因与责任，是否存在第三人，是否影响公共利益与他人合法权益，相对人是否存在欺骗、贿赂等不正当手段逃避行政处罚或者不配合行政机关调查取证等因素进行综合判断。

• 违法违纪线索移送：对于审判过程中发现的行政机关怠于行使职权而导致的超期处罚，人民法院可以将违法违纪线索依法向有关部门移送，以追究相关责任人的法律责任。

综上所述，案件超期的处理需要根据具体情况进行综合判断，并依据相关法律法规的规定作出相应的法律后果。如果您或他人遇到类似问题，建议及时咨询专业律师或相关法律机构以获取更具体的法律帮助。