当法定代表人起诉公司时，公司应由除法定代表人外的其他负责人、指定代表或律师来代表公司应诉。以下是对这一问题的详细分析：
一、法定代表人起诉公司的特殊性
法定代表人通常是代表公司行使职权的负责人，其以公司名义从事的民事活动所产生的权利义务由公司承担。然而，当法定代表人与公司之间发生纠纷，并且该纠纷是基于其个人名义进行的民事行为时，法定代表人与公司之间的地位变为平等，此时法定代表人有权以个人名义起诉公司。在这种情况下，由于法定代表人同时是原告，因此不能由其代表公司应诉，以避免角色冲突和不公正现象的发生。
二、公司应诉主体的选择
其他负责人：
- 公司应由除法定代表人外的其他负责人，如董事长（若非法定代表人）、副董事长、总经理等高级管理人员代表公司参与诉讼。这些负责人通常对公司业务有深入了解，能够代表公司进行有效的应诉。
指定代表：
- 若公司无其他合适的负责人，可通过股东会、董事会等决策程序临时指定一名代表，并出具授权委托书，以公司名义参加诉讼。这种方式可以确保公司在诉讼过程中有明确的代表，维护公司的合法权益。
律师：
- 公司也可以聘请律师作为诉讼代理人参与诉讼。律师具有专业的法律知识和丰富的诉讼经验，能够为公司提供全面的法律服务，包括分析法律关系、制定诉讼策略、进行辩论等。在复杂的知识产权纠纷、重大经济合同纠纷等案件中，律师的作用尤为重要。
三、法律依据与程序要求
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人、法定代理人可以委托一至二人作为诉讼代理人。在法定代表人起诉公司的案件中，由于法定代表人不能同时作为原告和被告出庭，因此公司需通过其他方式参与诉讼，如指定其他负责人或委托律师代理。
- 公司在确定应诉人员后，需向法院提交相关的身份证明文件和授权委托书等材料，以证明应诉人员的身份和权限，确保诉讼活动的合法性和有效性。
四、实际操作建议
及时咨询专业律师：
- 在面临法定代表人起诉公司的案件时，公司应及时咨询专业律师，了解案件的性质、法律关系和可能的法律后果，以便制定合理的应诉策略。
完善公司治理结构：
- 公司应完善治理结构，明确各负责人的职责和权限，避免在诉讼过程中出现角色冲突和无人应诉的情况。
积极准备应诉材料：
- 公司应积极准备应诉材料，包括相关证据、法律文件等，以支持自己的应诉主张。
总结来说，当法定代表人起诉公司时，公司应由除法定代表人外的其他负责人、指定代表或律师来代表公司应诉。公司应严格遵守相关法律法规和诉讼程序要求，确保应诉工作的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。