关于劳动合同如何约束已包含加班费的问题，以下是对此问题的详细解答：
一、加班费的法律规定与计算标准
首先，根据《中华人民共和国劳动法》、《劳动合同法》及《工资支付暂行规定》，加班费是为了保障劳动者在正常工作时间之外付出劳动后能获得合理报酬。加班费的计算标准根据加班的情形有所不同：
- 工作日加班：支付不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%作为加班费。
- 休息日加班：若不能安排补休，则支付不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%作为加班费。
- 法定节假日加班：支付不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%作为加班费。
二、劳动合同中关于加班费的约定
为了在劳动合同中明确约束加班费，用人单位和劳动者可以在合同中作出以下约定：
明确加班工资计算基数：
- 劳动合同中应明确约定加班工资的计算基数，该基数不得低于当地最低工资标准，并确保该基数与劳动者正常工作时间的工资标准相协调。
约定加班审批程序：
- 为了规范加班管理，劳动合同中可以约定加班需经过审批程序，例如填写加班申请表并经主管审批，以确保加班的合理性和必要性。
明确“工资已包含加班费”的条款：
- 如果用人单位希望将加班费包含在工资中，必须在劳动合同中明确约定，并确保该约定不违反法律法规的强制性规定。
- 该条款应明确说明工资中包含的加班费的具体数额或计算方式，以及加班时间和加班费的对应关系。
遵守最低工资标准：
- 即使劳动合同中约定了“工资已包含加班费”，折算后的正常工作时间工资也不得低于当地最低工资标准。
三、特殊情况及法律责任
特殊行业或岗位的加班规定：
- 对于医疗、交通、电力等特殊行业，可能实行不定时工作制或综合计算工时工作制，其加班认定和加班费计算有所不同，需根据相关法律法规进行具体约定。
用人单位的法律责任：
- 如果用人单位违反法律规定，未按照标准支付加班费，劳动行政部门将责令限期支付。
- 逾期不支付的，用人单位需按应付金额50%以上100%以下的标准向劳动者加付赔偿金。
四、注意事项
- 合同的真实意愿：劳动合同中关于加班费的约定必须是双方当事人的真实意思表示，不得存在欺诈、胁迫等情形。
- 证据的提供：用人单位应妥善保存工资表、工资明细表等证据，以证明已支付的工资包含加班费。
- 合同履行情况：在实际履行过程中，用人单位应严格按照劳动合同中的约定支付加班费，确保劳动者的合法权益得到保障。
综上所述，劳动合同中关于加班费的约定必须明确、合法，并严格遵守相关法律法规。用人单位应合理安排加班，确保劳动者的合法权益得到保障，避免不必要的法律纠纷。同时，劳动者在签订劳动合同时也应谨慎对待此类条款，了解自己的权利和义务。