合同只有一份，是可以进行扫描的。不过，关于合同扫描件的法律效力及其在不同场景下的应用，我们需要从多个角度来详细分析：
扫描件的法律效力：
- 扫描件作为合同原件的复制件，在法律上通常被视为与原件具有相同的证据效力，前提是扫描件能够真实、完整地反映原件的内容，且没有经过篡改。这意味着，如果扫描过程保持了合同的完整性和真实性，那么扫描件在法律上是可以被接受的。
- 然而，如果扫描件存在模糊、缺失或篡改的情况，其法律效力可能会受到质疑。在争议发生时，对方可能会提出异议，认为扫描件不能准确反映合同的真实内容。
扫描件在不同场景下的应用：
- 日常业务往来：在许多日常业务场景中，如合同签署后的存档、发送给合作伙伴或客户等，扫描件因其便捷性和高效性而被广泛使用。只要双方对扫描件的真实性没有异议，它就可以作为合同的有效证明。
- 法律诉讼或仲裁：在涉及法律诉讼或仲裁的情况下，扫描件的法律效力可能会受到更严格的审查。法院或仲裁机构可能会要求提供合同原件以进行比对和验证。如果无法提供原件，且扫描件存在瑕疵或争议，那么扫描件可能无法单独作为定案的依据。
建议与注意事项：
- 保持扫描件的清晰度和完整性：在进行扫描时，应确保扫描件清晰、完整，能够准确反映合同的所有内容。避免出现模糊、缺失或篡改的情况。
- 妥善保管合同原件：尽管扫描件在许多情况下可以替代原件使用，但合同原件仍然是最具法律效力的证据。因此，应妥善保管合同原件，以备不时之需。
- 在必要时进行公证或认证：如果扫描件需要在法律诉讼或仲裁中使用，且双方对其真实性存在争议，可以考虑对扫描件进行公证或认证。这可以增加扫描件的法律效力，提高其在法庭上的可信度。
综上所述，合同只有一份时是可以进行扫描的，但应确保扫描件的真实性和完整性。在不同场景下，扫描件的法律效力可能会有所不同。因此，在使用扫描件时，应根据具体情况谨慎处理，并遵循相关法律法规和合同条款的规定。如果你在合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。