在未完全停工停产的情况下，安排员工休息，工资是否发放需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
如果休息是公司正常的工作安排或调休：
- 在这种情况下，员工休息通常被视为正常出勤的一部分，因此公司应按照员工正常出勤时的工资标准支付工资。这包括基本工资、奖金、津贴等各项收入，确保员工在休息期间的收入与正常工作期间相同。
如果休息是由于公司经营困难或生产调整导致的非正常停工：
- 根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。
- 若停工停产超过一个工资支付周期，且劳动者提供了正常劳动，则支付的工资不得低于当地的最低工资标准。
- 若劳动者没有提供正常劳动，用人单位应按各省、自治区、直辖市规定的办法发放生活费，生活费标准通常低于最低工资标准。
如果休息是员工个人原因（如病假、事假等）：
- 在这种情况下，工资的发放将遵循公司内部的规章制度或劳动合同中的约定。
- 一般来说，病假期间公司会按照一定比例支付工资，而事假期间则可能不支付工资或扣除相应天数的工资。
法律建议：
- 对于公司而言，应明确休息的性质和原因，并按照相关法律法规和公司内部规章制度支付工资。同时，建议公司制定完善的工资支付制度，明确在不同情况下工资的支付标准和方式，以避免纠纷的发生。
- 对于员工而言，如果公司未按照约定支付工资，可以与公司进行协商沟通。若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司未按照法律法规支付工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 员工也可能因此提起劳动仲裁或诉讼，要求公司支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
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