您好，关于您提出的“门诊诊断证明建议休息，公司是否必须同意病假”的问题，这是一个涉及劳动者权益和公司管理权的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们要明确的是，健康权是劳动者重要的基本权利，当劳动者患病时，他们享有就医治疗及休息休假的权利。用人单位应当予以保障，不得阻碍或者限制劳动者的此项权利。这是基于劳动法的基本原则和劳动者权益保护的需要。

在实际操作中，用人单位为了加强病休假管理，有时会要求劳动者到指定医院就诊检查。这种做法的初衷在于防止劳动者弄虚作假“泡病假”，但用人单位在行使这一管理权时，应当审慎并合理。对于劳动者提供的非单位指定就诊医院出具的真实有效就诊资料及医生开具的病休证明，用人单位应进行审慎审查判别。在没有证据证明就诊资料及病休证明为虚假或伪造的情况下，用人单位应当给予批准休假。

以您提到的案例为例，如果劳动者提交了医疗机构出具的有效诊疗资料及主治医生开具的“病假证明书”，且这些资料真实有效，那么用人单位仅以与指定医院复查结果不相符为由而不予批准病假，是没有依据的。此外，如果用人单位的规章制度中关于病假不予批准的规定不区分劳动者是否存在过错等具体情形而一律按旷工处理，那么这种规定对无过错劳动者明显不公，不能作为解除劳动合同的依据。

另外，关于病假证明的出具，也有相关的法律法规进行规范。根据《中华人民共和国执业医师法》《医疗机构管理条例》等相关法律规定，病假证明是具有法律效力的重要医学文书。医疗机构及执业医师在出具病假证明时，必须遵守相关规定，如亲自诊查后签署、在患者病历中记录相应的诊疗情况、病假时间必须同时记录在门（急）诊病历中或者患者的出院记录中等。

综上所述，如果劳动者提交了真实有效的门诊诊断证明建议休息，且没有违反公司规章制度或相关法律法规的情况，那么公司应当同意其病假申请。公司不得以劳动者未到指定医院检查治疗为由而不予准假，更不得以违纪为由解除其劳动合同。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。