员工长期请病假，公司一般不能直接开除，但需根据具体情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、医疗期内的保护

1. 医疗期定义与时长：医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息，而不得解除劳动合同的时限。医疗期的长短根据员工的实际工作年限和在本单位工作年限来确定，例如，实际工作年限十年以下的，本单位工作年限五年以下的为三个月，五年以上的为六个月等，最长可达24个月。

2. 法律保护：在医疗期内，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条第三项的规定，员工享有法律保护，公司不得依据该法第四十条（无过失性辞退）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。若公司违法辞退，员工有权申请劳动仲裁，要求公司继续履行劳动合同或支付双倍经济补偿金。

3. 病假工资或疾病救济费：在医疗期内，公司应按规定支付病假工资或疾病救济费，且不得低于当地最低工资标准的80%。

二、医疗期满后的处理

1. 不能从事原工作或新工作：若员工医疗期满后，不能从事原工作也不能从事由公司另行安排的工作，公司需提前三十日以书面形式通知员工本人或额外支付一个月工资后，方可解除劳动合同，并需按员工工龄支付经济补偿金。经济补偿的计算公式为：经济补偿金=工作年限×月工资（工作年限每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资）。同时，根据劳动鉴定委员会的确认，公司可能还需支付不低于六个月工资的医疗补助费，患重病和绝症的应适当增加。

2. 能够从事相关工作：若员工医疗期满后，能够从事原工作或公司另行安排的工作，公司无正当理由不得开除员工，否则构成违法解除劳动合同，需承担相应法律责任，如支付赔偿金等。

三、特殊情况

• 弄虚作假：若员工长期请病假存在伪造病历、诊断证明等弄虚作假行为，公司在有充分证据证明的情况下，可以依据公司规章制度以严重违反规章制度为由解除劳动合同，且无需支付经济补偿，但需为员工结清工资。

四、综合建议

1. 明确医疗期：公司应首先明确员工的医疗期时长，确保在医疗期内不违法解除劳动合同。

2. 评估工作能力：医疗期满后，公司应评估员工的工作能力，根据实际情况合理安排工作或解除劳动合同。

3. 遵守法律法规：在处理员工长期请病假问题时，公司应严格遵守相关法律法规，确保操作合法合规，避免不必要的法律风险和经济损失。

4. 及时沟通协商：公司与员工之间应保持及时沟通，尽量通过协商解决问题，维护良好的劳动关系。

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