结论：政府利用抛荒农田变更林地再为民营企业申报工业用土地的行为，是否违法需分情况讨论，主要取决于变更土地用途的程序是否合法合规。
分析：
土地用途变更的合法性：
- 根据我国相关法律法规，土地用途的变更必须遵循严格的法定程序。这通常包括土地利用总体规划的调整、土地用途变更的审批、土地权属的变更登记等环节。
- 如果政府在变更土地用途时，未按照法定程序进行，如未经规划调整、未获得相关审批或未进行权属变更登记，那么这种变更就是违法的。
抛荒农田的处理：
- 抛荒农田本身并不直接决定其后续用途的变更是否合法。关键在于变更用途的程序是否合法，以及变更后的用途是否符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定。
- 如果政府在处理抛荒农田时，未依法进行土地复垦或未按照规划进行合理利用，而是擅自变更用途，这也可能构成违法。
为民营企业申报工业用土地的合法性：
- 政府为民营企业申报工业用土地，必须确保该土地用途的变更已经获得合法审批，并且符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定。
- 如果政府在未获得合法审批或未符合规划的情况下，为民营企业申报工业用土地，那么这种行为就是违法的。
具体建议：
- 核实变更程序：首先，需要核实政府变更土地用途的具体程序，包括是否获得了相关审批、是否进行了权属变更登记等。
- 审查规划符合性：其次，需要审查变更后的土地用途是否符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定。
- 咨询专业意见：如果对于变更程序的合法性或规划符合性存在疑问，建议咨询专业的土地法律律师或相关政府部门，以获取更准确的法律意见。
可能后果：
- 如果政府的行为被认定为违法，那么民营企业可能面临无法合法使用该土地的风险，甚至可能面临行政处罚或法律责任。
- 同时，政府也可能因违法变更土地用途而承担相应的法律责任，包括撤销变更决定、恢复土地原状、赔偿损失等。
进一步思考：
- 在处理此类问题时，除了关注法律程序的合法性外，还应考虑土地资源的合理利用和可持续发展。政府应依法依规进行土地用途变更，确保土地资源的有效利用和保护。
- 民营企业也应增强法律意识，在申报和使用土地时，务必确保土地用途的变更已经获得合法审批，并符合相关法律法规的规定。
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