结论：药店在已经受到一次行政处罚后，如果发现第二个问题，是否应该加重处理，这并非一个绝对的结论，而是需要根据具体情况来判断。

分析：

1. 行政处罚的法定原则：

   • 行政处罚的设定和实施必须遵循法定原则，即必须有明确的法律依据，且处罚的种类和幅度必须符合法律规定。
   • 在药店已经受到一次行政处罚后，如果再次发现违法行为，行政机关在决定是否加重处罚时，必须依据相关法律法规的规定。

2. 加重处罚的法定条件：

   • 加重处罚通常适用于违法行为情节严重、性质恶劣或者造成严重后果的情况。
   • 如果药店的第二个问题与第一个问题性质相同，且情节严重程度相当，那么行政机关在决定处罚时，可能会考虑药店的违法记录，但并不意味着必然加重处罚。
   • 如果第二个问题比第一个问题更为严重，或者药店在受到第一次处罚后仍未改正违法行为，那么行政机关可能会依法加重处罚。

3. 行政处罚的裁量权：

   • 行政机关在实施行政处罚时，享有一定的裁量权。这意味着行政机关可以根据违法行为的性质、情节、后果以及药店的整改情况等因素，综合判断并决定处罚的种类和幅度。
   • 因此，即使药店已经受到一次行政处罚，行政机关在决定是否加重处罚时，仍然需要综合考虑各种因素，而不是简单地根据违法次数来决定。

4. 具体案例的考量：

   • 在实际案例中，药店是否因第二个问题而受到加重处罚，取决于多个因素的综合考量。例如，药店的违法行为是否涉及公共安全、是否造成消费者损害、药店是否积极配合调查并整改等。
   • 如果药店在受到第一次处罚后，积极采取措施整改违法行为，且第二个问题并未造成严重后果，那么行政机关可能会选择从轻或减轻处罚。

建议：

• 对于药店而言，应严格遵守相关法律法规，确保经营活动的合法性和合规性。
• 如果药店已经受到行政处罚，应认真分析处罚原因，积极采取措施整改违法行为，避免再次受到处罚。
• 如果药店对行政处罚有异议或认为处罚过重，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

后续行动：

• 如果您是药店的经营者或相关负责人，且对行政处罚有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。