当合同备注和合同条款发生冲突时，其法律效力需根据具体情况判断，并非绝对以备注或原条款为准。以下从多个角度为你详细分析：
一、合同备注条款的法律效力基础
符合合同生效要件：
- 根据《民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效需满足：行为人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。若合同备注条款满足这些条件，则具有法律效力。
- 实例：在一份买卖合同中，主合同约定了商品的基本信息和价格，备注条款中补充了商品的特定质量标准，且该标准不违反法律法规，双方均具备民事行为能力，意思表示真实，则此备注条款有效。
不与主合同主要条款冲突：
- 备注条款通常作为对主合同的补充、说明或特别约定，若与主合同主要条款不冲突，应视为合同的一部分，具有同等法律效力。
- 实例：租赁合同中，主合同约定了租赁期限和租金，备注条款中约定了租客在租赁期间内对房屋的小修小补责任，此备注与主合同不冲突，因此有效。
遵循特定形式要求：
- 若合同对条款变更、补充有特定形式要求（如签字盖章），备注条款需满足这些要求才具效力。
- 实例：合同中规定“任何补充或修改均需双方签字并加盖公章”，则备注条款按此要求执行后，即产生法律效力。
二、合同备注条款与主合同条款冲突时的处理原则
意思表示优先原则：
- 当备注条款与主合同条款存在冲突时，应首先考察双方的真实意思表示。如果备注条款是双方在合同签订后，基于特定情况或协商一致而作出的补充或修改，且该意思表示真实、合法，那么备注条款通常应优先于主合同条款。
- 实例：在一份建设工程施工合同中，主合同约定了工程竣工日期，但后续因设计变更导致工期延长，双方在备注条款中重新约定了竣工日期，并签字确认。在此情况下，备注条款中的竣工日期应优先于主合同中的约定。
特别约定优先原则：
- 如果备注条款是针对主合同中的某一特定事项作出的特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么备注条款应优先于主合同中的一般性条款。
- 实例：在一份货物买卖合同中，主合同约定了货物的质量标准，但备注条款中针对某一批货物作出了更高的质量标准要求。在此情况下，备注条款中的特别约定应优先于主合同中的一般性标准。
不利解释原则（在模糊或歧义时）：
- 当备注条款与主合同条款均存在模糊或歧义，且无法通过其他方式明确双方真实意思表示时，可能适用不利解释原则。即，对作出模糊或歧义条款的一方不利解释。但这一原则并非绝对，需结合具体案情和法律规定判断。
三、无效或可撤销的备注条款情形
违反法律法规强制性规定：
- 如果备注条款的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该条款无效。
- 实例：在一份劳动合同中，备注条款中约定“员工在工作期间发生的一切事故，公司均不承担责任”，此约定违反了《劳动法》和《安全生产法》的相关规定，因此无效。
违背公序良俗：
- 如果备注条款的内容违背了社会公共秩序和善良风俗，那么该条款也不具有法律效力。
- 实例：在一份房屋租赁合同中，备注条款中约定“租赁房屋仅用于从事违法活动”，此约定违背了公序良俗，因此无效。
存在欺诈、胁迫等情形：
- 如果一方以欺诈、胁迫的手段使对方在违背真实意思的情况下订立了备注条款，那么受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销该条款。
- 实例：甲公司以威胁乙公司停止业务合作为手段，迫使乙公司在合同备注中作出不合理约定，乙公司可向法院或仲裁机构请求撤销该备注条款。
四、法律建议
在签订合同前仔细审查：
- 双方在签订合同前，应仔细审查合同的所有条款，包括备注条款，确保其真实、合法、有效。对于存在冲突的条款，应及时协商修改，以避免后续纠纷。
保留相关证据：
- 在合同履行过程中，双方应保留与合同相关的所有证据，包括书面合同、电子邮件、短信、聊天记录等。这些证据在后续纠纷解决中可能起到关键作用。
及时咨询专业律师：
- 如果双方对合同备注条款的法律效力存在争议，或者无法协商解决纠纷，应及时咨询专业律师。律师可以根据具体案情和法律规定，为双方提供专业的法律意见和解决方案。
总结：合同备注条款与主合同条款冲突时的法律效力需根据具体情况判断。在签订合同前，双方应仔细审查所有条款，确保其真实、合法、有效。对于存在冲突的条款，应及时协商修改或咨询专业律师以明确其法律效力及履行方式。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。