关于您提出的“厂里罚款两千是否合法”的问题，这确实是一个需要细致分析的情况。首先，我们要明确的是，罚款的合法性并非一概而论，而是需要根据具体情况来判断。
一、企业罚款权的一般原则
在我国，罚款是行政处罚的一种形式，它通常由具有行政处罚权的行政机关依法定程序和权限来作出。企业，作为民事主体，并不普遍具备对员工进行罚款的法定权力。如果用人单位直接以罚款的名义扣减员工工资，这很可能构成违法行为。
二、特定条件下的合法性判断
尽管企业一般无权罚款，但在某些特定条件下，公司可能采取一些经济处理措施，这些措施在严格意义上并不等同于罚款，但可能涉及工资的扣减。这些条件包括：
劳动合同或规章制度的明确规定：
- 如果公司的规章制度经过了民主程序制定（比如经过职工代表大会讨论通过），内容不违反法律法规，并且已经向员工公示，同时明确规定了违规行为及对应的处理措施（如扣除奖金、绩效等），那么公司在员工违规时依据这些制度进行处理，可能被视为合法。但关键在于，这种处理必须合理，且与员工的违规行为相匹配，不能显失公平。
- 如果规章制度未经民主程序制定、未向员工公示，或者罚款金额过高、明显不合理，那么公司据此进行的“罚款”行为将被视为不合法。
基于劳动合同约定的扣款：
- 如果劳动合同中明确约定了某些情形下公司可以扣除员工一定工资作为惩罚，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么在员工出现约定情形时，公司按合同约定执行可能具有一定合法性。但同样，扣款金额必须合理，且与员工的违约行为相适应。
经济损失赔偿：
- 如果员工因工作失误或失职给公司造成了经济损失，公司可以要求员工进行赔偿。但赔偿金额必须基于实际损失来计算，不能随意设定罚款金额。这种赔偿属于民事责任范畴，与罚款性质不同。
三、针对您情况的具体分析
对于您提到的“厂里罚款两千”的情况，我们需要考虑：
- 是否有明确的规章制度或劳动合同条款支持这一罚款？
- 这些规章制度或条款是否经过了民主程序制定，并向员工公示？
- 罚款金额是否合理，是否与员工的违规行为相匹配？
- 罚款后员工的工资是否仍然不低于当地最低工资标准？
如果上述任何一个条件不满足，那么这一罚款行为很可能被视为不合法。
四、员工权益保护
如果您认为公司的罚款行为不合法或不公平，您有权采取以下措施来维护自己的权益：
- 与公司协商：首先尝试与公司进行沟通，要求其说明罚款的依据和合理性。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报公司的违法行为。
- 申请劳动仲裁：如果投诉未能解决问题，您可以依法向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 提起劳动诉讼：如果仲裁结果仍不满意，您还可以依法向人民法院提起劳动诉讼。
总结：厂里罚款两千是否合法，取决于多个因素，包括是否有明确的规章制度或劳动合同条款支持、这些条款是否合法合理、罚款金额是否合理等。如果您认为罚款不合法，有权提出质疑并采取相应法律手段来维护自己的权益。