公司与银行合作贷款在符合相关法律法规的前提下是合法的。以下从多个角度为您详细分析：
合法性基础与条件
合法性基础：
- 公司与银行之间的贷款合作，本质上属于金融机构与法人之间的资金融通行为。根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第一条，虽然该规定主要调整的是自然人、法人和非法人组织之间的民间借贷，但银行作为经金融监管部门批准设立的从事贷款业务的金融机构，其贷款业务并不受该规定直接限制，而是遵循更为专门的金融法律法规。不过，从广义上讲，公司向银行申请贷款，也是公司获取资金的一种合法方式。
合法条件：
- 贷款合同依法订立：公司与银行之间的贷款合同必须体现双方真实意思，且内容合法合规，不违反法律、行政法规的强制性规定。
- 贷款用途合法：公司申请贷款时，必须明确贷款用途，且该用途必须合法合规，不得用于非法或违规目的。
- 符合银行贷款政策：公司需满足银行的贷款条件，如信用状况、还款能力等，且贷款申请需经过银行的审批流程。
税务处理与注意事项
税务处理：
- 公司从银行获得贷款后，需按照税法规定缴纳相关税费，如利息支出可能涉及的增值税（如果银行开具了增值税专用发票且符合抵扣条件）以及企业所得税（利息支出作为财务费用在税前扣除，但需符合税法规定的扣除条件）。
注意事项：
- 利率约定：公司与银行之间的贷款利率应遵循市场利率和银行内部规定，不得存在过高或过低的利率，以避免引发法律风险或税务问题。
- 还款计划：公司应制定合理的还款计划，并按时足额还款，以维护良好的信用记录。
- 合规性审查：在贷款过程中，公司应确保所有操作均符合相关法律法规和银行规定，避免出现违规行为。
不合法或存在风险的情况
- 违反法律法规强制性规定：如果公司利用贷款资金从事非法活动，或者与银行串通进行违法操作，如骗取贷款、洗钱等，那么这种贷款合作就是非法的，将受到法律的制裁。
- 银行违规操作：如果银行在贷款过程中存在违规行为，如未严格审查公司资质、违规发放贷款等，那么银行也可能面临法律风险和监管处罚。
- 损害公司利益：如果公司在贷款过程中未充分了解贷款条款和条件，或者未对贷款资金进行有效管理，可能导致公司利益受损，如高额利息支出、资金链断裂等。
实际操作建议
- 充分了解贷款条款：公司在与银行合作贷款前，应充分了解贷款条款和条件，包括贷款利率、还款方式、还款期限等，确保自己能够承担贷款成本并按时还款。
- 加强内部管理：公司应建立健全的财务管理制度，确保贷款资金的有效使用和管理，避免出现资金挪用、浪费等行为。
- 寻求专业法律意见：在贷款过程中，如果公司遇到法律问题或疑虑，应及时寻求专业法律意见，以确保自己的合法权益得到保障。
综上所述，公司与银行合作贷款在符合相关法律法规的前提下是合法的。但公司在贷款过程中也需注意合规性审查、税务处理以及内部管理等方面的问题，以确保贷款合作的顺利进行和公司的合法权益得到保障。如果您在贷款过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。