如果公司诬告员工贪污，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
保持冷静，收集证据：
- 在面对诬告时，员工首先要保持冷静，不要惊慌失措。
- 迅速收集与贪污指控无关的证据，如工作记录、交易凭证、同事证言等，以证明自己的清白。这些证据将有助于在后续的法律程序中证明自己的无罪。
与公司沟通，要求澄清：
- 员工可以尝试与公司管理层或人力资源部门进行沟通，要求公司澄清诬告的具体内容和依据。
- 在沟通过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的回应，以便更好地解决问题。
寻求法律援助，提起法律诉讼：
- 如果公司拒绝澄清或继续坚持诬告，员工应尽快寻求法律援助，咨询专业律师（即我，杨毅律师，专注于合同纠纷、刑事辩护领域）的意见。
- 根据律师的建议，员工可以考虑提起名誉权诉讼或诽谤诉讼，要求公司停止侵害、赔礼道歉，并赔偿因此造成的损失。在提起诉讼时，员工需要提交充分的证据来证明公司的诬告行为。
配合司法机关调查，维护自身权益：
- 如果公司已经向公安机关报案，员工应积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，并提供相关证据。
- 在调查过程中，员工有权要求司法机关保护自己的合法权益，避免受到不公正的待遇。
关注公司内部管理，防范类似事件：
- 员工可以借此机会关注公司的内部管理情况，了解公司是否存在管理漏洞或制度缺陷。
- 如果发现公司存在管理问题，员工可以向公司提出改进建议，以防范类似事件的再次发生。
法律背景与依据：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诬告陷害罪是指捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的行为。如果公司诬告员工贪污，且情节严重，可能构成诬告陷害罪，员工有权依法追究公司的刑事责任。
- 同时，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，公民享有名誉权，任何组织或者个人不得以侮辱、诽谤等方式侵害他人的名誉权。如果公司诬告员工贪污，损害了员工的名誉权，员工有权要求公司承担民事责任。
可能面临的法律后果：
- 如果公司被证实存在诬告行为，可能面临刑事责任的追究，如诬告陷害罪的定罪处罚。
- 同时，公司还可能承担民事责任，如赔偿员工因此造成的损失、赔礼道歉等。
建议与提醒：
- 在面对公司诬告时，员工应保持冷静和理性，不要采取过激行为或言语攻击公司。
- 及时寻求法律援助，咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
- 在整个过程中，员工应积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，并提供相关证据。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。