非法出版物主要由新闻出版行政部门进行管理，同时，文化市场综合执法机构、公安机关等部门也根据具体情况参与管理。以下是对这一问题的详细解答：
新闻出版行政部门：
- 根据《出版管理条例》及相关法律法规，新闻出版行政部门是出版物市场的主管部门，负责出版物的出版、印刷、复制、发行等环节的监管。
- 对于非法出版物，新闻出版行政部门有权进行查处，包括责令停止违法行为、没收出版物和违法所得、罚款等行政处罚。
文化市场综合执法机构：
- 在许多地区，文化市场综合执法机构承担着文化市场（包括出版物市场）的日常监管和执法任务。
- 它们有权对非法出版物进行查处，并可以与新闻出版行政部门协同工作，共同打击非法出版活动。
公安机关：
- 如果非法出版物涉及淫秽、色情、暴力、恐怖等违法内容，或者存在其他严重违法犯罪行为，公安机关将依法介入调查和处理。
- 公安机关有权对涉嫌犯罪的非法出版活动进行刑事立案侦查，并追究相关责任人的刑事责任。
在实际操作中：
- 当发现非法出版物时，首先可以向当地的新闻出版行政部门或文化市场综合执法机构举报。
- 如果非法出版物涉及严重违法犯罪行为，如传播淫秽物品、侵犯知识产权等，也可以直接向公安机关报案。
法律建议：
- 作为出版物市场的参与者或消费者，应增强法律意识，遵守相关法律法规，不参与非法出版活动。
- 如果发现非法出版物或相关违法犯罪行为，应及时向有关部门举报，共同维护出版物市场的健康秩序。
可能后果：
- 对于非法出版物的出版、印刷、复制、发行等行为，相关责任人将面临行政处罚或刑事处罚。
- 行政处罚可能包括罚款、没收出版物和违法所得、责令停业整顿等；刑事处罚则可能涉及有期徒刑、拘役、罚金等。
如有任何关于非法出版物管理的具体问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。