结论：私自扣职工工资20万元，即便在几年之内归还，仍有可能被追究刑事责任，但具体是否追究需视案件具体情况和相关法律规定而定。

分析：

1. 刑事责任的基础：

   • 私自扣职工工资，若数额较大，可能构成《中华人民共和国刑法》中的职务侵占罪或挪用资金罪（具体取决于行为人的身份和行为的性质）。职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。挪用资金罪则是指公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的行为。

2. 归还行为的影响：

   • 归还行为本身并不能完全消除刑事责任。虽然归还可能表明行为人有一定的悔过表现，但刑事责任的追究主要基于行为本身的违法性和社会危害性。归还可能作为量刑时的一个考虑因素，减轻处罚，但并不能免除刑事责任。

3. 刑事责任的追究条件：

   • 是否追究刑事责任，还需考虑多个因素，如行为人的主观故意、行为的具体情节、造成的后果、是否主动投案自首、是否积极退赔等。如果行为人能够证明自己没有非法占有的目的，或者存在其他法定从轻、减轻或免除处罚的情节，可能不会被追究刑事责任。

4. 法律程序：

   • 如果被追究刑事责任，将经历刑事侦查、审查起诉、审判等法律程序。在这些程序中，行为人有权委托律师进行辩护，维护自己的合法权益。

建议：

• 及时咨询：鉴于刑事责任的严重性，建议行为人或相关方及时咨询专业律师，了解具体的法律风险和可能的法律后果。
• 积极配合：如果已经被立案侦查或起诉，应积极配合司法机关的工作，如实陈述事实，提供相关证据，争取从轻或减轻处罚。
• 主动退赔：如果尚未归还全部或部分工资，应尽快主动退赔，以表明悔过态度，争取在量刑时得到从轻处理。

法律后果：

• 如果构成职务侵占罪或挪用资金罪，根据数额大小和情节严重程度，可能面临有期徒刑、拘役、罚金等刑事处罚。
• 除了刑事责任外，还可能面临民事赔偿责任，即需要赔偿被害单位因此遭受的损失。

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