在民事诉讼中，书记员的回避通常由院长决定。以下是关于这一问题的详细解释：

法律依据与决定主体

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，书记员如果存在法定回避情形，如与案件有利害关系、是本案当事人或当事人的近亲属等，应当回避。而关于书记员回避的决定主体，法律明确规定为院长。这意味着，当书记员需要回避时，应由院长来作出是否回避的决定。

回避制度的重要性

回避制度是民事诉讼中的一项重要制度，它旨在确保审判的公正性和客观性。通过回避制度，可以排除与案件有利害关系或其他可能影响公正审判的人员参与诉讼过程，从而保障当事人的合法权益。书记员作为诉讼过程中的重要角色，其回避同样受到法律的严格规范。

实际操作中的注意事项

1. 及时提出回避申请：如果当事人认为书记员存在法定回避情形，应及时向法院提出回避申请。申请应明确说明回避的理由和事实依据，以便法院进行审查。

2. 等待院长决定：提出回避申请后，当事人需要等待院长的决定。院长会根据法律规定和案件实际情况，对回避申请进行审查并作出决定。

3. 尊重决定结果：无论院长的决定是同意回避还是驳回申请，当事人都应尊重并遵守。如果对决定结果有异议，可以通过合法途径进行申诉或上诉。

特殊情况下的处理

在某些特殊情况下，如院长本身也需要回避时，书记员的回避决定可能会由其他适当的人员或机构来作出。这通常会在法律或法院内部规定中有明确说明。

法律建议

• 了解回避制度：当事人在参与民事诉讼前，应了解回避制度的相关规定，以便在需要时能够及时提出回避申请。
• 保留证据：如果认为书记员存在法定回避情形，应尽可能保留相关证据，以便在提出回避申请时能够提供有力支持。
• 咨询专业律师：在涉及回避等复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。

如有任何关于民事诉讼中书记员回避或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。