单位不配合工伤认定的，主要后果是可能面临行政处罚，并且不影响劳动者自行申请工伤认定及后续的工伤赔偿。以下从不同角度详细分析：

一、行政处罚角度

根据《工伤保险条例》的相关规定，用人单位应当按时为职工缴纳工伤保险费，并在职工发生工伤事故后，及时协助职工进行工伤认定申请。如果单位不配合，即未在规定时间内（一般为事故发生之日起30日内）提出工伤认定申请，社会保险行政部门可以责令其限期改正。若单位逾期不改正，社会保险行政部门有权对单位处以罚款，罚款金额根据具体情况而定，但一般会有一定的幅度，如2000元以上2万元以下的罚款。这一处罚措施旨在督促用人单位积极履行其法定义务，保障工伤职工的合法权益。

二、工伤认定及赔偿角度

1. 劳动者自行申请工伤认定：

   • 即使单位不配合，劳动者或其近亲属、工会组织也有权在事故伤害发生之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 社会保险行政部门在受理申请后，会依法进行调查核实，并根据调查结果作出工伤认定决定。

2. 工伤赔偿不受影响：

   • 一旦劳动者被认定为工伤，就有权享受工伤保险待遇，包括医疗费用、康复费用、住院伙食补助费、交通食宿费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金等。
   • 如果单位未依法为劳动者缴纳工伤保险费，那么这些工伤保险待遇将由单位自行承担。这意味着，即使单位不配合工伤认定，也无法逃避其应承担的赔偿责任。

三、实际操作建议

1. 保留证据：

   • 劳动者在发生工伤事故后，应尽快收集并保留相关证据，如医疗记录、事故现场照片、证人证言等。这些证据在后续的工伤认定和赔偿过程中将起到关键作用。

2. 及时申请工伤认定：

   • 劳动者或其近亲属、工会组织应在规定时间内向社会保险行政部门提出工伤认定申请，以确保自己的权益得到及时保障。

3. 寻求法律援助：

   • 如果单位不配合工伤认定或拒绝承担赔偿责任，劳动者可以寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的法律权益和维权途径。

举例说明：假设某劳动者在单位工作时发生工伤事故，但单位拒绝为其申请工伤认定。此时，劳动者可以自行收集医疗记录、事故现场照片等证据，并在事故发生之日起1年内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。一旦被认定为工伤，劳动者就有权享受工伤保险待遇。如果单位未依法缴纳工伤保险费，那么这些待遇将由单位自行承担。如果单位拒绝支付，劳动者可以通过法律途径追究单位的法律责任。

总结来说，单位不配合工伤认定不仅可能面临行政处罚，还无法逃避其应承担的工伤赔偿责任。因此，建议用人单位在发生工伤事故后积极履行其法定义务，配合劳动者进行工伤认定申请，以维护双方的合法权益。如果劳动者遇到单位不配合的情况，应及时采取措施保护自己的权益，有问题可以直接向我咨询。