核心结论：法人可先尝试通过协商、股东会决议等内部途径解决小股东占用公司印章问题；若内部途径无效，可通过诉讼等法律手段解决，同时要注意防范在此过程中的法律风险。以下是具体分析：

内部解决途径

1. 协商沟通
   • 法人可以首先尝试与小股东进行友好协商，明确指出其占用公司所有章的行为违反了公司章程以及相关法律法规，损害了公司和其他股东的利益。在协商过程中，要强调公司正常运营需要印章，要求小股东立即归还印章。
   • 例如，法人可以组织一次股东会议，在会议上以平和理性的态度与小股东沟通，说明印章对于公司签订合同、办理银行事务等重要业务的关键作用，若印章长期被占用，可能导致公司面临违约风险、资金流转困难等问题，进而影响所有股东的利益。
2. 依据公司章程和股东会决议
   • 查看公司章程中对于印章管理的规定，如果章程明确规定了印章的保管、使用和归还等事项，法人可以依据章程要求小股东归还印章。
   • 若公司章程没有明确规定，法人可以提议召开股东会，就小股东归还印章的事项形成股东会决议。根据《公司法》规定，股东会会议由股东按照出资比例行使表决权，一般事项经代表过半数表决权的股东通过即可。如果能够形成有效的股东会决议，要求小股东归还印章，小股东应当执行。

法律手段解决

1. 提起诉讼
   • 如果内部协商和股东会决议等方式都无法解决问题，法人可以代表公司向法院提起诉讼，要求小股东返还公司印章。在诉讼中，需要提供相关证据证明小股东占用印章的事实，以及该行为对公司造成的损害。
   • 例如，可以收集公司日常业务中因印章被占用而无法正常开展的证据，如合同无法签订导致的损失证明、银行事务无法办理的记录等。同时，要明确诉讼请求，即要求小股东立即返还公司所有印章，并承担因占用印章给公司造成的损失赔偿责任。
2. 申请行为保全
   • 在提起诉讼的同时，法人还可以向法院申请行为保全，请求法院裁定小股东立即停止占用公司印章的行为，并将印章返还给公司。行为保全可以在诉讼过程中及时制止小股东的侵权行为，避免公司损失进一步扩大。
   • 法院会根据具体情况审查行为保全申请，如果认为小股东占用印章的行为可能给公司造成难以弥补的损害，且法人提供了相应的担保，法院可能会裁定采取行为保全措施。

防范法律风险

1. 确保自身行为的合法性
   • 法人在采取上述措施的过程中，要确保自身行为符合法律法规和公司章程的规定。例如，在召开股东会时，要按照法定程序通知所有股东，确保股东会的召集和表决程序合法有效。
   • 如果法人在解决问题过程中存在违法行为，可能会面临法律责任，同时也可能影响公司后续对小股东的维权行动。
2. 注意证据的收集和保存
   • 在整个过程中，法人要注意收集和保存与小股东占用印章相关的证据，如与小股东的沟通记录、股东会决议、公司业务受影响的证明等。这些证据将在后续的协商、诉讼等过程中发挥重要作用，有助于证明小股东的侵权行为和公司的损失情况。