结论：乙方开具含税与不含税发票，对甲方是否有损失，这主要取决于甲乙双方之间的合同约定以及具体的交易场景。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果甲乙双方在合同中明确约定了交易价格是否包含税款，以及发票的开具方式（含税或不含税），那么按照合同约定执行即可。在这种情况下，乙方开具含税或不含税发票，通常不会对甲方造成额外的损失，因为合同已经对双方的权利和义务进行了明确界定。
   • 如果合同中没有明确约定交易价格是否含税，或者对发票的开具方式没有具体规定，那么乙方开具不含税发票可能会导致甲方在税务处理上遇到麻烦，比如需要自行承担税款，或者因为发票不合规而无法进行税前扣除等，从而间接造成经济损失。

2. 税务处理角度：

   • 从税务处理的角度来看，如果乙方开具的是不含税发票，甲方在收到发票后可能需要自行计算并缴纳相应的税款（如增值税）。这不仅增加了甲方的税务处理成本，还可能因为计算错误或延误缴纳而产生罚款或滞纳金等额外费用。
   • 如果乙方开具的是含税发票，甲方则可以直接按照发票上的金额进行支付，无需再额外计算税款，从而简化了税务处理流程，降低了税务风险。

3. 法律合规角度：

   • 根据相关法律法规，销售商品或提供服务的一方应当向购买方开具发票，并确保发票的真实性、合法性和有效性。如果乙方开具的是不合规的发票（如不含税发票但实际应含税），可能会面临税务机关的处罚，同时也会影响甲方的税务合规性。
   • 在极端情况下，如果因为乙方开具的不合规发票导致甲方被税务机关查处或受到其他法律后果，甲方还有可能向乙方追究法律责任，要求赔偿因此造成的损失。

建议：

• 为了避免潜在的税务风险和法律纠纷，甲乙双方在签订合同时应当明确约定交易价格是否含税以及发票的开具方式。
• 如果合同中没有明确约定，双方应当及时沟通并达成补充协议，以确保交易的合规性和顺利进行。
• 甲方在收到乙方开具的发票时，应当仔细核对发票的真实性、合法性和有效性，确保符合税务和法律的要求。

如有任何关于金融保险（税务及发票）或合同纠纷方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。