结论：员工在工作期间编制的程序，离职时全部删除可能构成违法，具体取决于程序的权属、删除行为对公司的影响以及是否存在相关协议约定。以下是对此问题的详细分析：
一、程序的权属判断
职务成果归属公司：
- 员工在工作期间，主要利用公司的物质技术条件、按照公司的任务要求开发完成的程序，属于职务作品或职务发明创造，其知识产权归公司所有。这意味着，即使程序是员工个人编写的，但如果使用了公司资源（如设备、技术资料、工作时间等），其所有权也可能属于公司。
- 法律依据：根据《中华人民共和国著作权法》第十八条，自然人为完成法人或者非法人组织工作任务所创作的作品是职务作品，除本条第二款的规定以外，著作权由作者享有，但法人或者非法人组织有权在其业务范围内优先使用。作品完成两年内，未经单位同意，作者不得许可第三人以与单位使用的相同方式使用该作品。然而，对于主要是利用法人或者非法人组织的物质技术条件创作，并由法人或者非法人组织承担责任的工程设计图、产品设计图、地图、示意图、计算机软件等职务作品，作者享有署名权，著作权的其他权利由法人或者非法人组织享有。
个人所有：
- 如果程序是员工在业余时间，完全利用自己的资源开发的，并且与公司的工作任务无关，那么该程序的所有权属于员工个人。但需注意，如果此前与公司签订了相关协议（如劳动合同、保密协议、竞业禁止协议等），且协议中有关于工作成果归属的约定，员工仍需遵守。
二、法律责任分析
侵权责任：
- 如果员工擅自删除属于公司的程序，给公司造成了损失，公司有权要求员工承担相应的侵权责任。赔偿责任可能包括重新开发程序的费用、业务停滞造成的损失等直接经济损失。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
刑事责任：
- 在某些情况下，如果删除程序对公司正常的生产经营活动造成了严重影响，甚至导致公司无法正常运转，这一行为可能构成破坏生产经营罪或其他相关刑事犯罪。
- 如果程序涉及公司核心业务、商业秘密，删除行为给公司造成重大经济损失，员工还可能面临故意毁坏财物罪或侵犯商业秘密罪的刑事指控。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，破坏生产经营行为，情节严重的，可处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；故意毁坏公私财物，数额较大或者有其他严重情节的，可处三年以下有期徒刑、拘役或者罚金；侵犯商业秘密，给商业秘密的权利人造成重大损失的，可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
违约责任：
- 如果员工与公司之间签订了相关协议，且协议中有禁止离职时删除某些工作相关内容的约定，那么员工的删除行为可能构成违约，公司有权依据协议要求员工承担违约责任，如支付违约金等。
三、职业道德与诚信原则
- 员工在离职时，应遵循诚实信用原则，完成工作交接手续，确保公司的正常运营不受影响。删除自己做的程序可能会对公司的运营造成困扰或经济损失，从职业道德的角度来看，员工应尊重公司的知识产权和财产权。
四、合法处理建议
- 权属明确：在离职前与公司明确程序的权属问题，避免后续纠纷。
- 充分沟通：与公司进行充分沟通，了解公司对程序的需求和期望，并按照公司要求完成工作交接。
- 遵守协议：严格遵守与公司签订的相关协议，不得擅自删除或破坏公司的数据或程序。
- 法律途径解决争议：如果与公司之间存在关于程序所有权的争议或纠纷，应通过合法的途径进行解决，如协商、调解或诉讼等。
总结：离职时删除自己做的程序需谨慎对待。员工应充分了解程序的权属情况、法律责任以及职业道德要求，并在离职前与公司进行充分沟通和妥善处理相关事宜，以避免不必要的法律风险和经济损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。