在案件中，“司机”一词的使用通常是规范且恰当的，尤其在涉及道路交通、非法营运等相关案件时。以下是对这一问题的详细解答：

首先，从法律和案件处理的角度来看，“司机”是描述驾驶车辆人员的常用且准确的术语。在非法营运案件中，如您提供的参考信息所示，驾驶员（即司机）往往是违法行为的直接实施者。例如，在保某某擅自从事道路客运经营行政处罚案中，保某某作为司机，驾驶车辆非法载客，是违法行为的直接责任人，被依法进行了处罚。

其次，在案件描述和认定过程中，使用“司机”一词有助于清晰界定违法行为的主体。在非法营运案件中，可能存在驾驶员与车辆所有人不一致的情况。这时，通过明确“司机”的身份，可以准确判断谁是违法行为的实施者，从而确保处罚对象的准确性。如参考信息中提到的，如果驾驶员自行实施非法营运行为，那么应当以驾驶员为处罚对象；如果驾驶员受车辆所有人指使，则应当以车辆所有人为处罚对象。

此外，使用“司机”一词也符合日常用语习惯和法律文书的表述规范。在法律文书中，为了准确、清晰地描述案件事实和法律关系，通常会使用专业且通俗易懂的术语。而“司机”作为描述驾驶车辆人员的常用术语，既符合日常用语习惯，也符合法律文书的表述规范。

综上所述，在案件中使用“司机”一词是规范且恰当的。它有助于清晰界定违法行为的主体，确保处罚对象的准确性，并符合日常用语习惯和法律文书的表述规范。因此，在涉及道路交通、非法营运等相关案件时，可以放心使用“司机”一词来描述驾驶车辆的人员。