分公司有官司时，一般不能直接以存在官司为由申请暂停营业，但可根据具体情况通过合法途径实现暂停营业目的。具体分析如下：

1. 分公司诉讼与营业状态的关系
   分公司作为总公司的分支机构，其民事责任由总公司承担。分公司涉及诉讼本身并不直接导致其必须暂停营业，法律未规定诉讼程序与营业状态存在必然关联。但若诉讼涉及分公司核心资产（如经营场所、设备）被查封，或因诉讼导致员工流失、供应链中断等客观障碍，可能间接导致无法正常经营。

2. 实现暂停营业的合法途径

   • 主动申请停业：若分公司因诉讼导致经营困难（如资金链断裂、客户流失），可依据《公司法》及工商登记规定，向市场监管部门申请办理停业手续。需提交总公司决议、财务状况说明等材料，说明停业必要性。
     
   • 被动停业情形：若诉讼涉及财产保全（如银行账户冻结、资产查封），或因违法行为被行政机关责令停业（如环保处罚、税务稽查），分公司可能被迫暂停营业。此时需配合司法/行政程序，及时处理纠纷以恢复营业。
     
   • 破产程序介入：若分公司负债超过资产，可由总公司或债权人申请破产。法院受理破产申请后，分公司将进入清算程序，此时营业活动需依法停止。

3. 风险提示与建议

   • 擅自停业的法律后果：若未履行法定程序擅自停业，可能面临工商部门行政处罚（如罚款、吊销营业执照），甚至影响总公司信用评级。
     
   • 诉讼策略调整：建议结合诉讼类型制定应对方案。例如，若为合同纠纷，可尝试和解或调解以减少对经营的影响；若为侵权诉讼，需评估是否需调整业务模式以规避风险。
     
   • 总分机构责任划分：需明确总公司与分公司的责任边界。若分公司债务需总公司承担，总公司应提前评估风险，必要时通过内部决议限制分公司经营权限。

行动建议：

1. 立即梳理诉讼案件类型、标的额及可能影响范围；
   
2. 评估分公司资产状况及持续经营能力，决定是否主动申请停业；
   
3. 咨询专业律师制定诉讼应对策略，同步处理工商、税务等合规事宜。
   

如有进一步细节（如诉讼类型、分公司资产状况等），可向我补充说明，我将提供针对性分析。