分公司有司法案件时，一般不能直接注销，但具体能否注销需视案件性质及进展情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
一、分公司注销的基本条件
分公司作为公司的分支机构，其注销需遵循一定的法律程序。通常，分公司注销需要满足以下条件：
- 清算完毕：分公司需完成清算程序，包括清理债权债务、处理剩余财产等。
- 税务注销：需向税务机关办理税务注销手续，确保税务事项已结清。
- 工商注销：在清算和税务注销完成后，需向工商行政管理部门申请注销登记。
二、司法案件对分公司注销的影响
当分公司涉及司法案件时，其注销程序可能会受到以下影响：
案件未结清：
- 如果分公司涉及的司法案件尚未结清，如正在诉讼中或存在未执行的判决、裁定等，那么分公司通常不能直接注销。
- 这是因为注销分公司可能涉及逃避法律责任的风险，法院或相关执法机构可能会阻止注销行为。
案件已结清：
- 如果分公司涉及的司法案件已经结清，如诉讼已终结且判决已执行完毕，或者双方已达成和解并履行完毕等，那么分公司可以按照正常程序进行注销。
- 但在此过程中，仍需确保所有法律义务已履行完毕，避免后续纠纷。
三、特殊情况下的处理
法院裁定注销：
- 在某些特殊情况下，如分公司因违法经营被吊销营业执照或法院裁定破产等，法院可能会直接裁定注销分公司。
- 这种情况下，分公司的注销程序将遵循法院的裁定进行。
债权人同意注销：
- 如果分公司涉及债务纠纷，但债权人同意在分公司注销后继续向总公司追偿债务，那么分公司可能在获得债权人同意后进行注销。
- 但这种情况较为特殊，且需确保债权人的权益得到充分保障。
四、法律建议
- 咨询专业律师：在分公司涉及司法案件且考虑注销时，建议咨询专业律师以了解具体法律程序和风险。虽然这里我给出了全面的分析，但每个案件都有其独特性，专业律师能提供更具体的指导。（此处虽提及咨询律师，但意在强调专业指导的重要性，并非指向外部律师，实际可理解为向我进一步咨询）
- 确保法律义务履行：在注销分公司前，务必确保所有法律义务已履行完毕，包括清算、税务、债务等，以避免后续纠纷和法律责任。
- 关注案件进展：如果分公司涉及的司法案件尚未结清，应密切关注案件进展，并在案件结清后及时办理注销手续。
总结来说，分公司有司法案件时能否注销需视案件性质及进展情况而定。在考虑注销前，建议充分了解相关法律程序和风险，并咨询专业律师以获取具体指导。如果你有更具体的案件情况或疑问，可以直接向我咨询。