结论：养殖场是否为违建，不能仅凭建设时间或政府单方面的说法来判断，而需综合考虑土地使用权、规划许可、建设时间、政策法规及环保要求等多方面因素。针对您提到的“建多年的养殖场政府说是基本农田是违建”这一问题，以下是我的详细分析：
一、不属于违建的情形
历史合规性：
- 若养殖场在建设时严格遵循了当时所在地区的土地利用总体规划、养殖相关规划和政策，并经过了合法的审批手续（如取得用地许可、养殖许可证等），即使建设时间较长，且现在政府称其为基本农田，也不一定属于违建。特别是如果当时该地块并未被划定为基本农田，或者养殖场建设符合当时对基本农田使用的特殊规定（如有临时使用许可等），则更不应被简单认定为违建。
手续补办与认可：
- 对于早期因法律法规不完善、管理不规范等原因导致手续不全的养殖场，若其建设符合土地利用总体规划和养殖发展规划，且不妨碍公共利益和他人合法权益，政府可能会引导养殖户逐步完善相关手续，而非直接认定为违建。如果政府现在提出违建问题，您可以咨询是否可以通过补办手续来解决问题。
二、属于违建的情形
未办理用地审批手续且占用基本农田：
- 基本农田受到严格保护，严禁任何单位和个人在其上进行非农业建设。若养殖场建设占用的土地确实属于基本农田，且未按照规定办理农用地转用审批手续，擅自将农用地用于建设养殖场，则违反了土地管理法规，可能会被认定为违建。
违反城乡规划：
- 随着城乡发展，若养殖场所在区域被纳入城乡规划范围，且其建设不符合现行的城乡规划要求（如位于禁止养殖区域、影响公共设施建设和安全等），也可能会被认定为违建。例如，养殖场建在规划的城市公园用地范围内，就属于违反城乡规划的建设行为。
未取得相关养殖许可或违反环保要求：
- 从事养殖活动通常需要取得养殖许可证等相关证件，并符合环保、防疫等方面的要求。若养殖场一直未取得合法养殖许可，或违反环保规定（如未建设配套的污染防治设施，对畜禽粪便、污水等进行不合理处理和处置等），也可能被视为违法经营和建设，存在被认定为违建并依法处理的风险。
三、建议与行动
核实土地性质与规划：
- 首先，您需要核实养殖场所占土地的性质是否确实为基本农田，以及该地块在建设养殖场时的规划情况。这可以通过查询当地的土地利用总体规划图、城乡规划图或咨询当地自然资源主管部门来实现。
审查审批手续与证件：
- 审查养殖场建设时是否办理了用地审批手续、养殖许可证等相关证件。如果手续不全或证件过期，应尽快咨询当地政府部门或专业律师，了解补办手续或更新证件的具体流程和要求。
咨询专业意见与应对：
- 如果政府已经提出违建问题，并可能采取拆除等强制措施，建议您尽快咨询专业律师（即我本人），了解具体的法律后果和应对策略。我可以根据您的具体情况提供针对性的法律意见和指导，帮助您维护合法权益。
关注政策法规变化：
- 养殖场经营者应关注相关政策法规的变化情况，及时调整经营策略和管理方式，确保养殖场的合法性和合规性。例如，如果政府出台了新的养殖用地政策或环保要求，应及时了解并遵守相关规定。
最后，养殖场是否为违建是一个复杂的问题，需要综合考虑多方面因素。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况提供详细的法律意见和指导。