项目建设工程结算金额超合同金额是否合理，需根据具体情况分析，不能一概而论。以下从多个角度为您详细阐述：
一、合同约定角度
存在价格调整条款：
- 若合同中明确规定了因原材料价格波动、工程量变更等特定情形下的价格调整机制，且结算金额超出部分符合调整条件，那么超出部分应按照条款规定的程序操作，此时超出合同金额是合理的。
- 实例说明：如合同中约定，若钢材价格上涨超过一定比例，工程价款可相应调整。若实际施工中钢材价格确实上涨且超过了约定比例，那么结算金额超出合同部分就是合理的。
存在变更程序条款：
- 若结算金额超出是因合同变更所致，应确认是否遵循了约定的变更审批程序。若未经适当审批的变更，可能影响超出部分的结算合理性。
- 实例说明：如合同中规定，任何工程变更均需双方书面确认并签字盖章后方可生效。若实际施工中发生了变更，但未经双方书面确认，那么结算时超出合同部分可能就不被认可。
二、超出原因角度
工程量增加：
- 对于因业主额外要求、设计变更等导致的工程量增加，若能收集到相关证据（如工程变更指令、施工图纸修改记录等）以证明工程量增加的事实，那么结算金额超出合同部分就是合理的。
- 实例说明：如业主在施工过程中要求增加一层楼或改变部分房间的功能布局，导致工程量增加，那么结算时超出合同部分就是合理的。
价格上涨：
- 若因市场原材料价格上涨、人工成本增加等因素导致结算金额超出，应分析合同对此类风险的分担约定。若合同中未明确约定风险分担方式或约定由业主承担部分风险，且能收集到市场数据、价格指数变化等证据支持调整申请，那么超出部分也可能是合理的。
- 实例说明：如合同签订后，国家出台了新的环保政策导致部分原材料价格上涨，且合同中未明确约定此类风险由谁承担，那么施工方可以与业主协商调整工程价款。
其他因素：
- 考虑不可抗力、业主方原因导致的工期延误等特殊情况，依据合同中相关条款收集证据，明确责任和确定可结算的金额。若因业主方原因导致工期延误，且合同中约定了工期延误的赔偿方式或工程价款调整方式，那么结算时超出合同部分也可能是合理的。
三、处理方式角度
友好协商与补充协议：
- 在明确超出原因和证据后，主动与合同相对方进行沟通协商，以书面形式详细说明超出原因、依据及计算方式，并提出合理的结算要求。若双方达成一致意见，可签订补充协议，明确超出部分金额的结算方式、支付时间等具体条款。补充协议应与原合同具有同等法律效力。
第三方鉴定或评估：
- 若协商过程中存在较大争议，可共同委托有资质的工程造价鉴定机构或专业评估机构对超出部分进行鉴定或评估。鉴定或评估报告可作为双方协商或后续法律程序的重要参考依据。
法律途径：
- 若协商和第三方鉴定均无法解决问题，可考虑通过法律途径解决争议。包括向有管辖权的人民法院提起诉讼或根据合同中的仲裁条款向仲裁机构申请仲裁。在法律程序中，应充分准备证据材料，按照法定程序进行举证、质证等环节，以维护自身合法权益。
四、法律依据角度
- 《中华人民共和国民法典》：合同编对合同的订立、履行、变更、违约责任等方面做出详细规定，为处理工程合同中的违约行为和未约定事项提供法律依据。
- 《建设工程价款结算暂行办法》：对建设工程价款的结算方式、工程变更价款的调整、竣工结算等方面做出具体规定，为解决工程价款纠纷提供参考依据和具体操作指南。
总结与建议：项目建设工程结算金额超合同金额是否合理，需根据合同约定、超出原因、处理方式以及法律依据等多方面进行综合分析。在处理过程中，建议双方保持冷静、理性对待，首先依据合同条款进行初步判断和处理；其次通过友好协商寻求共识；必要时可借助第三方专业力量进行鉴定或评估；最后若仍无法解决争议，则应及时采取法律手段维护自身权益。在整个过程中，双方应注重证据的收集和保存，以确保在处理争议时能够有据可依、有理可循。若您在此过程中遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询。