合同未履行时，已缴纳的印花税能否退还，需根据具体情况及法律法规来确定。一般情况下，合同签订后即产生印花税的纳税义务，即使合同最终未履行，已缴纳的印花税也不能退还。但在特定情况下，如应税凭证所列金额发生变更或合同被取消、解除且未履行，纳税人可以申请退税或抵缴。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的处理
纳税义务的产生：
- 根据《中华人民共和国印花税法》第十五条规定，印花税的纳税义务发生时间为纳税人书立应税凭证或者完成证券交易的当日。这意味着，印花税的缴纳以应税凭证的书立为标志，而非合同是否实际履行。一旦签订了应税合同，就产生了印花税的纳税义务。
合同未履行的处理：
- 合同签订后，无论是否履行，纳税人都需按规定缴纳印花税。例如，甲公司与乙公司签订了一份买卖合同并缴纳了印花税，即使后来合同未能履行，已缴纳的印花税也不能申请退还。这是因为印花税是一种行为税，其纳税义务的产生基于应税合同的签订，而非合同的实际履行。
二、特殊情况下的退税规定
应税凭证所列金额发生变更：
- 根据《财政部 税务总局关于印花税若干事项政策执行口径的公告》（财政部 税务总局公告2022年第22号）第三条第二款规定，如果应税合同、产权转移书据所列的金额与实际结算金额不一致，并且变更了应税凭证所列金额，那么纳税人可以就减少部分的金额向税务机关申请退还或者抵缴印花税。
合同被取消或解除且未履行：
- 在合同未履行或未完全履行的情况下，如果合同被取消或者双方协商解除，并且该合同的印花税已经缴纳，理论上纳税人是可以申请退还已缴纳的印花税的。但具体的退税流程和所需材料可能因地区和政策差异而有所不同。因此，在实际操作中，建议纳税人咨询当地税务部门以获取准确的指导和帮助。
三、实际操作与注意事项
及时咨询税务部门：
- 在处理合同印花税问题时，由于涉及具体的税收政策和操作流程，建议纳税人及时咨询当地税务部门或专业律师（如我），以获取准确的指导和帮助。
保留相关凭证和资料：
- 纳税人应保留好与合同相关的所有凭证和资料，如合同文本、支付凭证、沟通记录等。这些资料在申请退税或抵缴时可能作为重要的证据支持。
合理主张权益：
- 在申请退税或抵缴时，纳税人应合理、合法地提出要求，避免过度维权或采取不当手段。同时，也应了解并遵守相关的税收政策和操作流程。
总结与建议：合同未履行时印花税能否退还并非一概而论，而是需要根据具体情况及相关法律法规来判断。在处理此类问题时，建议纳税人仔细审查合同条款、了解相关税收政策，并在必要时咨询当地税务部门或专业律师（如我）以获取准确的指导和帮助。同时，也应注意保留好相关凭证和资料，以便在申请退税或抵缴时能够提供充分的证据支持。