结论前置：公司检查乙肝是否违规，需根据具体情况分析。一般情况下，未经员工同意进行乙肝检查可能侵犯隐私权，构成违规；但在特定行业如食品、药品、幼教等，因涉及公共卫生安全，相关法规可能要求乙肝检查，此时需确保检查合法、公正且结果保密。
详细分析：
一般情况下的乙肝检查规定：
- 根据相关法律法规，用人单位在招、用工过程中，除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止从事的工作外，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。这意味着，在普通入职体检或职业健康检查中，公司未经员工同意擅自检查乙肝相关项目是违规的，可能侵犯员工的隐私权等相关权利。
- 例如，如果一家普通公司在新员工入职时，未经员工同意就安排乙肝检查，这种行为就可能构成违规，员工有权拒绝并可以向相关部门投诉。
特殊职业情况下的乙肝检查规定：
- 对于某些特定职业，如食品生产经营、饮用水生产供应、公共场所服务、托幼机构保育等，由于这些职业直接涉及公共卫生安全，相关法律法规可能要求员工进行乙肝项目检测。在这些特定职业的入职体检中，公司要求检查乙肝项目是符合规定的。
- 但即便如此，公司也需确保检查过程的合法性、公正性，并严格保密检查结果，以保护员工的个人隐私权。例如，一家幼儿园在招聘保育员时，根据相关规定要求应聘者进行乙肝检查，这是合法的，但必须确保检查过程规范，且检查结果不被泄露。
公司应遵守的法律原则：
- 无论何种情况，公司在进行乙肝检查时，都应充分尊重员工的权益，确保检查行为的合规性。公司应事先征得员工的明确同意，并告知检查的目的、范围以及结果的保密措施。
- 公司还应建立健全的隐私保护机制，确保员工的个人信息不被泄露或滥用。如果公司违反这些原则，可能面临法律责任，如赔偿员工损失、接受行政处罚等。
总结与建议：
- 对于员工而言，如果公司未经同意安排乙肝检查，可以拒绝并了解相关法律法规，维护自己的合法权益。
- 对于公司而言，在进行乙肝检查时，必须严格遵守相关法律法规，充分考虑员工的权益和隐私保护。对于一般情况下的乙肝检查，应避免擅自进行；对于特定职业要求的乙肝检查，应确保检查过程的合法、公正与保密。
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