结论：已达成工伤赔偿协议，但协议显失公平的，伤者仍然可以申请劳动仲裁，并在必要时向人民法院起诉。
一、协议显失公平的法律后果
在工伤赔偿协议中，如果赔偿金额远低于法定标准，导致双方权利义务不对等，这种协议可能被认定为显失公平。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，显失公平的合同，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。因此，在协议显失公平的情况下，伤者有权申请劳动仲裁，要求撤销原协议，并按照法定标准重新获得赔偿。
二、申请劳动仲裁的流程与注意事项
申请仲裁的时效：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，伤者应在发现协议显失公平后，及时在规定的时效期间内申请劳动仲裁，以免错过维权时机。
证据收集与准备：
- 在申请劳动仲裁前，伤者应尽可能收集相关证据，如工伤赔偿协议、医疗证明、工资单、工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书等，以支持自己的主张。这些证据将直接影响仲裁结果，因此务必确保证据的充分性和合法性。
仲裁申请书的撰写：
- 伤者需要撰写仲裁申请书，明确阐述自己的仲裁请求、事实和理由。在申请书中，应详细说明协议显失公平的具体情况，以及为何要求撤销原协议并按照法定标准重新获得赔偿。
三、向人民法院起诉的流程与注意事项
起诉条件：
- 如果劳动仲裁机构支持了伤者的仲裁请求，撤销了原协议，但用人单位仍不履行赔偿义务，或者伤者对仲裁结果不满意，伤者可以向人民法院提起诉讼。
- 起诉时，伤者需要提交起诉状、相关证据材料以及仲裁裁决书（如有）等文件。
诉讼流程：
- 人民法院在受理案件后，将依法进行审理。在审理过程中，伤者需要出庭陈述事实、提供证据，并接受法院的询问和调查。
- 法院将根据事实和法律规定，作出判决或裁定。如果判决支持伤者的诉讼请求，用人单位需要履行赔偿义务；如果判决不支持伤者的诉讼请求，伤者需要接受法院的判决结果。
诉讼注意事项：
- 在诉讼过程中，伤者应遵守法庭纪律，尊重法官和对方当事人，不得进行任何扰乱法庭秩序的行为。
- 伤者应积极配合法院的审理工作，及时提供证据材料，并按照法院的要求参加庭审等活动。
四、建议与总结
在签订协议前充分了解权利与义务：
- 伤者在签订工伤赔偿协议前，应充分了解自己的权利和义务，以及法定赔偿标准等相关信息。这有助于避免签订显失公平的协议，从而维护自己的合法权益。
及时咨询专业律师：
- 如果伤者对协议内容或赔偿标准存在疑问，或者发现协议显失公平，应及时咨询专业律师。律师将根据伤者的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。
积极维护自身权益：
- 在发现协议显失公平后，伤者应积极采取行动，通过申请劳动仲裁或向人民法院起诉等方式，维护自己的合法权益。不要因为害怕麻烦或担心败诉而放弃维权机会。
总之，已达成工伤赔偿协议但协议显失公平的，伤者仍然可以申请劳动仲裁并在必要时向人民法院起诉。在维权过程中，伤者应充分了解自己的权利和义务，及时咨询专业律师，并积极维护自身权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的帮助，请直接向我咨询。