公司将员工公积金基数按工资额的一半缴纳是不合法的。这种行为违反了《住房公积金管理条例》的相关规定，下面我将从法律背景、法律建议和可能的法律后果三个角度为你详细分析：

法律背景

根据《住房公积金管理条例》的规定，职工住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以职工住房公积金缴存比例；单位为职工缴存的住房公积金的月缴存额同样以职工本人上一年度月平均工资为基数。这意味着，公积金的缴存基数应当是职工的实际工资，而不是工资的一部分或任意数额。

法律建议

1. 与公司沟通：

   • 如果你发现公司未按你的实际工资为基数缴纳公积金，首先可以尝试与公司进行沟通，要求其按照实际工资足额缴纳。

2. 向相关部门投诉：

   • 如果沟通无果，你可以向当地的住房公积金管理中心投诉。投诉时，提供你的工资单、劳动合同等证据，以证明公司未按实际工资缴纳公积金。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果问题复杂或涉及金额较大，你可以考虑寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和代理服务，帮助你维护自己的合法权益。

可能的法律后果

1. 公司面临处罚：

   • 住房公积金管理中心有权责令公司限期办理公积金缴存手续；逾期不办理的，可处以1万元以上5万元以下的罚款。
   • 如果公司逾期不缴或少缴公积金，住房公积金管理中心还可以责令其限期缴存；逾期仍不缴存的，可以申请人民法院强制执行。

2. 公司需承担赔偿责任：

   • 如果因公司未按实际工资缴纳公积金导致你权益受损（如公积金贷款额度降低、无法享受公积金提取等），公司还可能需要承担赔偿责任。

举例说明： 假设你的月工资为10000元，但公司只按5000元作为公积金缴存基数。按照规定，你的公积金月缴存额应为10000元乘以缴存比例（如12%），即1200元；而公司实际只按5000元计算，月缴存额仅为600元。这样，你每月就少缴了600元公积金，长期下来，这将是一笔不小的损失。

综上所述，公司按工资额的一半缴纳公积金是不合法的。如果你遇到这种情况，建议及时与公司沟通或向相关部门投诉，以维护自己的合法权益。如果你需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问。