结论前置：擅自将工业厂房用于商业用途，可能会面临行政处罚、民事赔偿以及刑事责任（在极端严重的情况下）等多方面的法律后果。以下是对这一问题的详细分析：
一、行政处罚
违反规划用途：工业厂房通常有其特定的规划用途，如生产、仓储等。若未经相关部门批准，擅自改变其用途为商业用途，如开设商店、餐厅等，这首先违反了城市规划和土地管理的相关规定。根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，相关部门有权对此类行为进行处罚，包括但不限于责令停止违法行为、限期改正、罚款等。
违反消防安全规定：工业厂房与商业建筑在消防安全方面有着不同的标准和要求。擅自改变用途可能导致消防安全设施不达标，从而违反消防安全规定。根据《中华人民共和国消防法》，相关部门可以对此类行为进行处罚，包括责令改正、罚款、停产停业等。
二、民事赔偿
合同违约：如果工业厂房的租赁或购买合同中明确规定了其用途，且承租人或购买人擅自改变用途，这可能构成合同违约。出租人或出售人有权要求承租人或购买人承担违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。
侵权责任：擅自改变工业厂房用途还可能对周边环境、居民生活等造成影响，从而构成侵权。在这种情况下，受影响的第三方有权要求侵权人承担侵权责任，包括停止侵害、赔偿损失等。
三、刑事责任（极端严重情况下）
在极端严重的情况下，如擅自改变工业厂房用途导致重大安全事故或环境污染事件等，相关责任人还可能面临刑事责任的追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，如重大责任事故罪、污染环境罪等，相关责任人可能面临有期徒刑、罚金等刑事处罚。
四、建议与措施
合法合规使用：在使用工业厂房时，应严格遵守其规划用途和相关法律法规的规定，确保合法合规使用。
及时咨询与审批：如需改变工业厂房的用途，应及时向相关部门咨询并办理审批手续，确保变更用途的合法性和合规性。
加强安全管理：无论工业厂房用于何种用途，都应加强安全管理，确保消防安全、生产安全等方面的达标和合规。
总结与进一步思考：擅自将工业厂房用于商业用途是一个复杂且敏感的问题，涉及多个方面的法律后果。在实际操作中，应充分考虑各种因素，确保合法合规使用工业厂房。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。