被立案调查的人一般不能担任基金会秘书长，但具体还需根据立案调查的性质、进展以及相关法律法规的具体规定来判断。以下从不同角度进行分析：
法律法规的普遍要求：
- 根据《基金会管理条例》等相关法律法规，基金会的秘书长作为高级管理人员，应当具备相应的资格条件，包括但不限于良好的品行、专业能力以及无违法犯罪记录等。被立案调查往往意味着个人可能涉及违法或违规行为，这与其担任基金会秘书长所需的品行要求相悖。
立案调查的性质与影响：
- 如果立案调查涉及的是与基金会管理、慈善活动等直接相关的违法或违规行为，那么被调查人显然不适合继续担任或担任基金会秘书长。因为这可能损害基金会的声誉，影响基金会的正常运营，甚至可能引发法律风险。
- 如果立案调查与基金会管理无直接关联，但调查结果可能影响被调查人的个人信誉或品行评价，那么这也可能成为其担任基金会秘书长的障碍。因为基金会作为公益组织，其高级管理人员的品行和信誉至关重要。
实际操作中的考量：
- 在实际操作中，基金会通常会要求拟任秘书长提供无犯罪记录证明或其他相关证明文件，以证明其符合担任高级管理人员的资格条件。如果被立案调查的人无法提供这些证明文件，或者其立案调查情况被公开后引发社会质疑，那么基金会可能会考虑不任命其为秘书长。
- 此外，即使被立案调查的人最终被证明无罪或调查未发现其存在违法违规行为，但在调查期间，其担任基金会秘书长可能会引发不必要的争议和关注，对基金会的形象和运营造成负面影响。
法律建议：
- 对于被立案调查的人而言，如果其有意担任基金会秘书长，应首先了解相关法律法规和基金会章程的具体要求，评估自身是否符合担任该职位的资格条件。
- 同时，被调查人应积极配合调查工作，尽快澄清事实真相，以消除潜在的法律风险和声誉损害。
- 对于基金会而言，在任命秘书长时，应严格审查拟任人员的资格条件，包括其品行、专业能力以及无违法犯罪记录等。必要时，可以要求拟任人员提供相关证明文件或进行背景调查。
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