交通执法部门对货运公司违规超载行为的处理方式主要包括以下几种：

1. 责令改正并卸载超载货物
   根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，货运机动车超过核定载质量的，交通执法部门有权扣留车辆至违法状态消除，并要求货运公司立即卸载超载货物，恢复车辆合法装载状态。这是最直接的处理方式，旨在消除安全隐患。

2. 罚款处罚

• 罚款标准：根据超载比例不同，罚款金额有所区分。例如，超载30%以下的，通常处200-500元罚款；超载30%以上的，处500-2000元罚款。具体金额需结合地方性法规（如《XX省道路交通安全条例》）确定。
  
• 法律依据：罚款依据《道路交通安全法》第九十二条及地方实施细则，罚款需开具正式行政处罚决定书，并告知救济途径。

1. 扣留机动车驾驶证
   若货运车辆超载严重（如超载50%以上），执法部门可扣留驾驶员机动车驾驶证，并要求其参加交通安全学习。扣留期限根据违法情节轻重，一般为1-3个月，目的是通过限制驾驶资格倒逼企业规范管理。

2. 对货运单位实施“一超四罚”
   根据《公路安全保护条例》第六十六条，交通执法部门需对货运公司实施“一超四罚”：

   • 罚企业：对货运公司处5000-30000元罚款；
     
   • 罚车辆：暂停涉事车辆运营资质1-3个月；
     
   • 罚驾驶员：对驾驶员扣分并罚款；
     
   • 罚源头：若能追溯货物装载源头（如工厂、仓库），需对源头单位处1000-5000元罚款。
     这一措施旨在从企业、车辆、人员、源头多维度遏制超载行为。

3. 强制整改与信用惩戒

• 整改要求：执法部门可要求货运公司限期整改，提交书面整改报告，并接受复查。
  
• 信用惩戒：超载行为可能被录入企业信用档案，影响其参与招投标、政府采购等资格，甚至面临行业禁入。

补充说明：

• 执法程序：交通执法部门需遵循《行政处罚法》程序，包括现场检查、取证、告知权利、听取陈述申辩、作出处罚决定等环节，确保程序合法。
  
• 救济途径：货运公司若对处罚不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但需在法定期限内（通常60日内复议，6个月内诉讼）提出。
  

建议：货运公司应严格遵守核定载质量标准，建立内部装载审核机制，避免因超载面临行政处罚及运营风险。如有具体案件需进一步分析，可直接向我咨询。