关于个人电动车二手转让签协议是否有效的问题，这主要取决于协议的内容以及双方是否按照法律规定进行了相应的过户手续。

首先，从法律层面来说，个人电动车二手转让时签订的协议是具有法律效力的。这份协议可以明确双方的权利和义务，比如转让价格、车辆状况、交付时间等，是保障双方权益的重要文件。只要协议内容合法、双方自愿签订，并且没有违反法律法规的强制性规定，那么这份协议就是有效的。

然而，仅仅签订协议并不足以完全保障双方的权益。因为电动车作为交通工具，其所有权和使用权的转移还需要通过过户手续来完成。过户手续是电动车转让过程中必不可少的一环，它不仅能够确认车辆的所有权已经转移，还能够避免后续可能出现的纠纷和风险。

在过户过程中，双方需要准备一些必要的材料，比如身份证明、转让证明（即你们签订的协议）、行驶证等。具体流程可能因地区而异，但一般来说，原车主需要提交过户申请，新车主需要填写相关资料并提交，然后双方携带相关材料到可办理过户登记的上牌网点进行车辆查验。查验通过后，新车主就可以选择行驶证的领取方式，并支付相关费用，完成过户手续。

举个例子，如果你在深圳进行电动车二手转让，你需要让原车主填写转让证明，并且和身份证一起手持拍照（转让证明模版可以在相关渠道下载获取）。然后，新车主凭此证明、新车主身份证原件、行驶证、原车牌等材料，骑车去交警大队或车管所办理转让过户。

因此，我建议你在进行个人电动车二手转让时，不仅要签订详细的转让协议，还要按照法律规定完成过户手续。这样，你才能更全面地保障自己的权益，避免后续可能出现的纠纷和风险。