结论：自己种的果树被烧毁后，清理再补种本身并不犯法，但具体是否违法需根据烧毁的原因、清理补种的方式及是否侵犯他人权益等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、果树被烧毁的原因

1. 自然因素：

   • 如果果树是因为自然灾害（如雷击、山火等）被烧毁，那么这属于不可抗力事件，您清理再补种的行为完全合法，无需承担任何法律责任。

2. 人为因素：

   • 非故意行为：如果果树是因为他人的非故意行为（如邻居家失火蔓延至您的果园）被烧毁，您同样有权清理再补种。但在此情况下，您可能需要与造成火灾的责任方协商赔偿事宜，以弥补您的损失。
   • 故意行为：如果果树是被他人故意烧毁，那么该行为可能构成故意毁坏财物罪或放火罪（如果危害公共安全）。在此情况下，您应立即报警，并保留相关证据以便追究犯罪者的法律责任。同时，您清理再补种的行为本身并不违法，但需确保在清理过程中不侵犯他人的合法权益。

二、清理再补种的方式

1. 合法清理：

   • 在清理被烧毁的果树时，您应确保不破坏周边的生态环境，不侵犯他人的土地使用权或相邻权。例如，不要随意丢弃烧毁的树枝和果实，以免对环境造成污染或对他人造成损害。

2. 合法补种：

   • 补种果树时，您应遵守相关的土地管理法规和农业种植规定。例如，不要在禁止种植的区域补种果树，不要使用违禁的农药和化肥等。

三、是否侵犯他人权益

1. 土地使用权：

   • 确保您清理再补种的果树位于您合法使用的土地上。如果果树原本就种植在您的土地上，那么您当然有权进行清理和补种。但如果果树位于他人的土地上或存在土地使用权争议，那么您需要先解决土地使用权问题，再进行清理和补种。

2. 相邻权：

   • 在清理和补种过程中，您应尊重相邻权人的合法权益。例如，不要因为清理和补种行为而影响相邻土地的正常使用或造成相邻土地的损害。

四、法律建议

1. 保留证据：

   • 如果果树是被他人故意烧毁，您应立即拍照、录像或寻找目击者等，以保留相关证据。这些证据将有助于您追究犯罪者的法律责任或要求赔偿。

2. 及时报警：

   • 如果怀疑果树是被他人故意烧毁，您应立即报警并配合警方的调查工作。警方将依法处理此类犯罪行为，并保护您的合法权益。

3. 咨询专业人士：

   • 在清理和补种过程中，如果您对相关的土地管理法规、农业种植规定或侵权责任等方面存在疑问，建议咨询专业的律师或农业技术人员，以确保您的行为合法合规。

总结：自己种的果树被烧毁后，清理再补种本身并不犯法。但您需要确保烧毁的原因合法、清理再补种的方式合法且不侵犯他人的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。